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中国西藏近缘野生大麦5S rDNANTS序列分析  
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【英文题名】 Comparative Analysis of Sequences of the 5S rDNA NTS in Wild Close Relatives of Barley from Tibet of China
【作者】 谭睿;
【导师】 丁毅;
【学位授予单位】 武汉大学;
【学科专业名称】 遗传学
【学位年度】 2004
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 武汉大学
【网络出版投稿时间】 2006-03-27
【基金】 国家自然科学基金
【关键词】 西藏野生大麦; 5S核糖体DNA; NTS;
【英文关键词】 Tibet relative wild barley 5S; nuclear ribosomal DNA; NTS;
【中文摘要】 选取来自西藏不同地理区域的16份近缘野生大麦材料和1份栽培大麦以及1份国外的近缘野生大麦材料,利用直接PCR,T-载体转化克隆,克隆产物测序的方法获得了它们的5S核糖体DNA NTS(Nontranscribed intergenic spacer)序列。对这些序列进行了测定、分析和比较,构建了分子系统树。研究结果表明,西藏近缘野生大麦NTS序列包括两段相对保守的保守区A和保守区B以及一段变异较大的变异区V,变异区由若干个TAG碱基的重复序列构成。两段保守区总长度为168-169bp,长度变异较小,仅相差1bp。保守区的GC%含量为43.8%,其中有12个核甘酸位点发生变异(占总核甘酸数目的7.1%),变异位点基本上是颠换多于转换,颠换/转换率为1.0-2.0。变异区中TAG重复序列的重复次数从4到17次,而且有部分TAG重复发生了颠换和转换(TAG→TCG,TAG→TAC)。TAG重复序列的多态性是决定NTS序列多态性的主要因素。对近缘野生大麦和麦属其他作物的比较,认为rDNA NTS适合作为亚属间分类的分子标记。
【英文摘要】 Tibet is a center of distribution and differentiation of genus Hordeum in China, and has a great deal of species resource. The sequences of the nontranscribed intergenic spacer (NTS) region of 5S nuclear ribosomal DNA was studied in 16 varieties of the wild relative of barley {Hordeum spontaneum) from different geographical range from Tibet of China. These sequences were determined by sequencing of PCR products clones. Alignment of sequences suggest that the 5S rDNA NTS contains two comparatively conserved ...
【更新日期】 2006-05-15

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导师:丁毅    导师单位:武汉大学    学位授予单位:武汉大学
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