基于芯片和低深度测序的大白猪繁殖性状多群体基因组选择研究

【作者】 郑扬勋； 李涛； 祁鑫； 韩新龙； 张宁； Florence Ytournel； 丁向东；

【机构】 中国农业大学动物科学技术学院,畜禽生物育种全国重点实验室,畜禽育种国家工程实验室,农业农村部动物遗传育种与繁殖(家畜)重点实验室； 河南丰源和普农牧股份有限公司； 阿克苏兴疆牧歌食品股份有限公司； 北京顺鑫农业股份有限公司小店种猪分公司； 河南牧业经济学院动物科技学院； 法国AXIOMSAS育种公司；

【摘要】 <正>引言在基因组选择中,参考群体的规模对基因组育种值估计的准确性具有重要作用,单一群体构建的参考群常因样本量有限而难以达到理想的预测准确性。因此,有必要整合不同来源或遗传背景的群体扩大参考群规模,以提升基因组预测准确性。此外,母猪的繁殖性状的遗传力普遍较低,传统育种方法选择效果有限。然而,当两个群体的遗传背景一致时,SNP位点与因果变异的连锁不平衡在两个群体中不一致^[1],即存在基因型与环境互作（G×E）,若忽视它的存在,可能会降低基因组预测的效果。本研究以中国三个种猪场的大白猪群体为研究对象,通过整合不同来源的参考群,包括存在G×E情况下,评估其对繁殖性状基因组选择准确化性和无偏性的影响,为基因组选择提供实践参考。更多还原