银耳附属染色体的多态性与起源研究：对基因组分化与结构变异的深入解析

【作者】 张金香； 吴小平； 邓优锦；

【机构】 福建农林大学菌物研究中心；

【摘要】 附属染色体虽然对真菌的正常生长和发育并非必需,但在子囊菌门真菌中的研究已较为深入,而在担子菌门中的报道则相对较少。本研究对来自不同来源的16株银耳(Tremella fuciformis)进行了全基因组测序,获得了27条完整的单倍型基因组序列,用于比较分析。结果显示这些基因组在大小上存在显著差异,变异幅度超过三分之一,主要由附属染色体和核心染色体中的重复序列引起。银耳基因组包含8至10条核心染色体,其多态性主要源于染色体之间的融合或分离。每个基因组含有2至10条附属染色体,共计107条,这些附属染色体的分布模式与系统发育关系及其与Annulohypoxylon stygium的配对特异性密切相关。附属染色体通常较小,富含转座子或重复序列,基因密度较低,但它们之间的同源性明显高于核心染色体。附加染色体表现出快速而多样的结构变异(SV),导致各系统发育分支内共享基因比例低于核心染色体。在银耳两种形态细胞类型的生长和转化过程中,核心和附属染色体均表现出高频的染色体拷贝数变异。大多数附属染色体上的基因与核心染色体上的基因不具同源性,且其编码的蛋白质在NCBI nr数据库中缺乏匹配序列。本研究首次揭示了担子菌门中附属染色体的多样性,并对其起源提供了新的见解,认为这些染色体可能起源于银耳物种分化之前尚未被探索的其他物种。更多还原