三株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析

【作者】 谢芝勋； 董建宝； 唐小飞； 刘加波； 庞耀珊； 邓显文； 谢志勤；

【机构】 广西兽医研究所； 广西大学动物科学技术学院；

【摘要】 根据GenBank公布的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的全基因序列,设计了8对引物,运用RT—PCR方法获取了三株H9N2亚型AIV广西地方分离株A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00的全基因序列,并对所得序列进行了比较分析。同源性分析及遗传进化分析发现,所分离的三个毒株的各基因与A/Chicken/Guangdong/4/00和A/Chicken/Jiangsu/1/00的相应基因的核苷酸序列有着较高的同源性和较近的亲缘关系,可能起源于同一种系。所分离毒株中每个毒株的8个基因,在遗传进化树上的分支不具有统一性,说明此三个毒株可能为不同基因亚系间发生自然重排的产物。氨基酸序列比较发现,A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00三株AIV的na基因核苷酸序列在开放性阅读框架的187～195位均缺失了ACAGAGATA共9个核苷酸,它们所编码的氨基酸为T、E、I。三个分离株的HA蛋白第226位氨基酸均为Gln,证明它们为非人类易感性的H9N2亚型AIV。更多还原