湖北省烟草镰刀菌根腐病SSR遗传多样性分析

【作者】 杨丹； 黎妍妍； 曹春霞；

【机构】 湖北省生物农药工程研究中心； 湖北省烟草科学研究院；

【摘要】 烟草是我国重要的经济作物之一,由镰刀菌引起的烟草根腐病作为一种世界性病害,对我国烟草的危害程度逐年加重。由于镰刀菌的多型性与易变异的特点,使得镰刀菌一直都是真菌类群中最难鉴定的属之一。随着分子生物学的迅速发展,DNA分子标记技术已被广泛地应用于生物群体遗传多样性研究,SSR分子标记技术具有多态性高、重复性好、分类学专化性、操作简单等特点,被应用在研究病原菌分类方面,该技术被认为是研究植物病原菌遗传变异与进化最理想的分子标记。为明确湖北烟草镰刀菌菌株间的遗传差异与亲缘关系,采用SSR分子标记技术聚类分析了83株地理来源不同的镰刀菌的遗传多样性。结果表明:4对引物在所有菌株个体中共检测出25个等位基因位点。其中,最小等位基因数目为1,最大等位基因数目为14。有效等位基因总数为12.9,平均每个位点有效等位基因数目为3.2。多样性指数表明,来自丹江口群体的遗传多样性均高于襄阳和恩施群体。基因流与遗传分化指数均表明3个群体之间的遗传分化较小,在遗传距离上,恩施和襄阳的群体更为接近。ANOVA差异性分析结果表明:种群内的遗传变异比例为95%,种群间的比例为5%,这说明群体内出现的遗传变异远大于群体间的遗传变异,即菌株间的遗传差异大于地区间的群体差异。基于Nei’s (1983)遗传距离的UPGMA聚类结果表明:丹江口和襄阳地区的菌株聚为一类,恩施地区的菌株单独聚为一类,UPGMA聚类结果与菌株的地理来源有一定的相关性,聚类图中来自同一类群的菌株在地理来源上更为接近。更多还原