黑木耳种质资源遗传特性研究及形质数据库建立

【作者】 崔玉玲； 姚方杰； 尹莉岚；

【机构】 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心； 吉林农业大学园艺学院；

【摘要】 简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)广泛分布于真核生物基因组中,其位点高度可变,呈共显性,重复性高,已应用于种质资源鉴定、分子标记辅助育种及交配型鉴定等方面。本研究以57株黑木耳菌株为研究对象,开展SSR分子标记遗传特性分析并在此基础上构建了黑木耳形质数据库。利用黑木耳全基因组序列设计出6对多态性好的引物和24对分布于黑木耳8条遗传连锁图谱上特异性强的引物,在此基础上基于SSR多态性进一步筛选出9对条带清晰明确、多态性信息含量高的核心引物,可将供试菌株完全区分开。9对SSR引物共检测到36个等位位点,每对引物平均具有4个多态性位点,有效等位变异数(Ne)为3.2396±1.2718,观测杂合度(Ho)为0.341±0.069,期望杂合度(He)为0.645±0.047,Shannon’s信息指数为1.1851±0.4085,多态性信息含量(PIC)值介于0.381-0.860之间,多态性含量较为丰富,共获得86个0/1位点信息,构建了包含菌株分子身份证、菌株编号、菌株类型、商品特征和菌株来源的形质数据库,为黑木耳种质的保护、鉴定、管理及新品种开发提供了技术支撑。更多还原