【作者】 许舒迪； 潘振远； 尹霏梵； 杨庆勇； 林忠旭； 温天旺； 朱龙付； 张大伟； 聂新辉；

【机构】 石河子大学农学院/绿洲生态重点实验室； 华中农业大学信息学院/农业生物信息学湖北省重点实验室； 华中农业大学植物科学技术学院/作物遗传改良国家重点实验室； 新疆农业科学院经济作物研究所；

【摘要】 [目的]数量性状位点(QTL)的Meta分析,是一种依赖于计算机的统计分析方法,是以参考图谱为基础,对来自多个定位研究中QTL结果进行整合,鉴定出一致性QTL,并将其精细定位到同一参考图谱上。Meta-QTL区间、显著SNPs和转录组分析相结合,已被广泛应用于多种植物候选基因的鉴定。[结果]在本研究中,基于棉花参考基因组TM-1,对来源于12个研究中的884个棉花纤维品质相关的QTL进行Meta-QTL分析,结果共鉴定到了74个meta-QTL,包括:19个纤维长度(FL)相关的Meta-QTL,18个纤维强度(FS)相关的Meta-QTL,11个纤维长度整齐度指数相关(FU)的Meta-QTL,11个纤维断裂伸长率(FE)相关的Meta-QTL,15个纤维马克隆值(MIC)相关的Meta-QTL。结合来源于15篇研究报道的8 589个棉花纤维品质显著相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,在上述的Meta-QTL区间共鉴定到了297个候选基因;其中20个候选基因在发育的棉花纤维中高表达。根据候选基因的功能注释,其中多数基因和纤维的发育相关。[结论]本研究不仅为分子标记辅助选择(MAS)提供了稳定的棉花纤维品质相关的QTL,还筛选了与棉纤维发育相关的候选基因,为探明纤维发育分子机制奠定基础。更多还原