三峡库区秀丽白虾群体的遗传多样性分析

【作者】 王东； 黄美茜； 曹贻宁； 熊飞； 刘红艳； 翟东东；

【机构】 江汉大学生命科学学院,湖北省汉江流域特色生物资源保护开发与利用工程技术研究中心； 江汉大学,持久性有毒污染物环境与健康危害湖北重点实验室；

【摘要】 为了解三峡库区甲壳类优势物种秀丽白虾群体的遗传多样性和遗传结构,利用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因序列作为分子标记,分析了三峡库区库首(袁水河)、库中(万州、丰都和木洞河)和库尾(江津)共5个秀丽白虾群体的遗传多样性、群体遗传结构和种群历史动态。结果显示三峡库区秀丽白虾群体的遗传多样性处于较高水平,整体单倍型多样性为0.920,整体核苷酸多样性为1.400%。分子方差分析(AMOVA)表明群体内部是遗传变异的主要来源占总遗传变异的93.29%。固定系数为0.0671且显著,暗示三峡库区秀丽白虾群体间可能存在中等程度的遗传分化现象。群体间成对遗传分化指数FST值显示,袁水河群体与库中3个群体间存在遗传分化现象,江津群体与库中3个群体间也存在遗传分化现象。种群非先验识别的结果与FST值相吻合,均表明袁水河与江津群体和其他群体遗传簇的组成存在一定的差异。贝叶斯(BI)系统发育树和单倍型网络图表明三峡库区秀丽白虾群体的单倍型可以划分为两支,且这两支间存在11步突变的差异。中性检验和错配分析表明,三峡库区秀丽白虾群体在历史上可能没有发生过种群扩张现象,贝叶斯天际线(BSP)分析表明袁水河和江津群体在近700年间可能发生了种群收缩现象。三峡库区秀丽白虾较高的遗传多样性暗示其可能具有丰富的种质资源,可以开展良种选育等工作。其次三峡库区秀丽白虾群体间存在一定的遗传分化现象,在管理或开发三峡库区秀丽白虾资源时应当划分多个管理单元。更多还原