病毒分类与命名的新规则

【作者】 范在丰；

【机构】 中国农业大学植物保护学院农业农村部植物检疫性有害生物监测防控重点实验室； 中国农业大学三亚研究院崖州湾科技城；

【摘要】 国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)1973—2011年先后发表了九次《病毒分类与命名》报告。在1995年出版的ICTV第六次报告中,植物病毒与动物病毒和细菌病毒一样实现了按科、属、种加以分类。2019年起,新的病毒分类系统(即ICTV第十次报告)陆续发表在线版的各种类型病毒分类规则(近年来,通过Journal of General Virology,Archives of Virology以及ICTV网站发表以科为主的最新分类报告及分类与命名相关规定,以后不再出版分类报告纸质版)。ICTV在2019年批准了新的病毒分类系统,确定了病毒的各级分类阶元,最高阶元为域(realm),每个阶元下面可以有亚阶元,即域(亚域)、界(亚界)、门(亚门)、纲(亚纲)、目(亚目)、科(亚科)、属(亚属)和种。目前(至2023年4月)病毒共归类为6域、10界、17门(2亚门)、40纲、72目(8亚目)、264科(182亚科)、2 818属(84亚属)、11 273种。病毒属不再保留代表种/典型种(type species),病毒科下面也不再有暂定种。6个病毒域分别为:古菌DNA病毒域(Adnaviria)、双链DNA病毒域(Duplodnaviria)、单链DNA病毒域(Monodnaviria)、多样DNA病毒域(Varidnaviria)、核酶病毒域(Ribozyviria)及RNA病毒域(Riboviria,包括基因组为dsDNA的副反转录病毒)。所有依赖于RNA聚合酶进行复制的病毒,包括基因组为双链DNA的副反转录病毒(pararetroviruses)均归入RNA病毒域(Riboviria)中。各级分类阶元(域、界、门、纲、目、科、属与种)及亚阶元的名称均应为斜体。病毒的名称分为种名(学名)和普通名称(俗名)。病毒种名如Tobacco mosaic tobamovirus后不能加缩写(TMV),但病毒的普通名称后可加缩写(例如,tobacco mosaic virus,TMV)。今后所有病毒的学名将采用拉丁双名(病毒属名+种加词);第二个词(种加词)多数为拉丁文形容词,或者从任何词根创建的拉丁化单词;新发现的病毒可以直接用拉丁学名命名,例如,埃布利柑橘凹胶病毒的学名为Coguvirus eburi;现在已经正式批准的病毒种名,可以继续使用,例如,白草花叶病毒目前的学名为Pennisetum mosaic potyvirus,其拉丁学名建议定为Potyvirus penniseti。种加词可以是拉丁字母、数字、字符集等文本的组合,但不能只用一个拉丁字母或阿拉伯数字。更多还原