基于EST-SSR标记的柞蚕遗传多样性分析

【作者】 钟亮； 徐亮； 刘彦群； 焦阳； 刘书禹； 谌苗苗；

【机构】 辽宁省蚕业科学研究所； 沈阳农业大学生物技术学院；

【摘要】 柞蚕是大蚕蛾科鳞翅目泌丝昆虫,柞蚕产业是辽宁省特殊我优势产业,2016年辽宁省下发《辽宁省产业精准脱贫规划(2016-2020)》,将柞蚕产业列入16个精准扶贫产业之一。我国保存有柞蚕品种100余份,我们拥有世界最大的柞蚕种质资源库,这些种质资源是柞蚕产业发展的重要物质基础。简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)是一种广泛应用于动植物遗传多样性分析,与分子辅助育种的分子标记技术。该技术采用PCR扩增每个位点的DNA序列,通过电泳分析核心序列的多态性。SSR在真核生物整个基因组中普遍分布,几乎每个基因都存在至少一个SSR位点。从单拷贝区域筛选SSR标记,如基于基因表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)开发EST-SSR分子标记是一种节约、可行的方法。本文基于4个EST-SSR分子标记,分析了11个具有典型差异形状的柞蚕品系的遗传多样性,采用遗传多样性软件进行相关数据整理与比较。结果显示,4个位点共检测到等位基因28个,平均有效等位基因数(effective number of allele,Ne)为2.507,基因观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.182～0.400,期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.524～0.658,Shannon信息指数(Shannon information index,I)为0.909～1.363,群体分化系数(population differentiation coefficien,Fst)均值为0.337。群体的平均多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)为0.239～0.477,遗传距离为0.085～1.305。对11个柞蚕品系的遗传多样性分析进一步确认了柞蚕中等程度的遗传多样性,且近60%的遗传变异存在于品系内个体间。研究结果表明EST-SSR标记可用于柞蚕的分子系统学研究,肯定了柞蚕在进化过程中的人为作用。为今后柞蚕种质资源鉴定与评价及品种改良,柞蚕品种的更新换代工作提供了理论基础。更多还原