基于质谱定量分析食管癌细胞异常蛋白修饰网络

【作者】 郭振昌； 翟贵金； 田姗姗； 许丽艳； 李恩民； 张锴；

【机构】 天津市医学表观遗传学协同创新中心天津医科大学； 汕头大学医学院；

【摘要】 食管癌是我国高发的致死癌症之一,只有不到10%的食管癌病人存活期可以超过五年。目前的研究认为食管癌患者存活率较低,这与食管癌细胞具有较高的侵袭和转移能力有关,然而其肿瘤分子机理尚不十分明确。因此食管癌蛋白分子网络的鉴定,特别是异常表达蛋白的深度分析,对揭示食管癌的机制具有十分重要的意义1。本研究采用定量蛋白质组学策略,以高侵袭性的食管癌细胞SHEEC和相应的食管上皮细胞SHEE为目标,分别采用轻、重稳定同位素进行细胞蛋白氨基酸标记(SILAC),通过多维液相色谱分离,蛋白修饰串联富集并结合高分辨质谱,鉴定了两种细胞蛋白质组和翻译后修饰组。共鉴定了7000多个蛋白质,以及上千个磷酸化、赖氨酸乙酰化、琥珀酰化修饰位点。采用多种生物信息学工具,进一步对差异性蛋白进行分析,研究了食管癌和上皮细胞表达差异性的蛋白和修饰分布规律、分子网络及通路。结合代谢组学和转录组分析,我们进一步研究了与肿瘤发生相关的异常蛋白通路和修饰网络,并明确了食管癌细胞琥珀酰化的明显下调。在此基础上,运用生化手段、裸鼠实验以及临床样品分析,发现了这一现象与食管癌发现的联系。本工作的开展为食管癌分子机制研究和潜在抗肿瘤药物靶点的发现提供了线索。更多还原