蓖麻TRAP标记开发及种质资源鉴定

【作者】 杨婷； 陆建农； 殷学贵；

【机构】 广东海洋大学；

【摘要】 【研究背景】蓖麻是重要的工业用油作物。由于独特的物理和化学性质,蓖麻油及其衍生成为众多工业领域的宝贵原料。但相对滞后的蓖麻遗传和育种研究,使蓖麻油供给严重不足。充分利用蓖麻种质资源,培育高产、优质、强适应性蓖麻品种迫在眉睫。蓖麻DNA指纹图谱的构建可为高效评价和利用蓖麻种质资源提供手段。TRAP(靶位区域多态性)标记,具有简单、稳定、可访问基因相关区域等优点。国内外学者用AFLP,SSR,SNP,RAPD,SRAP,EST-SSR等分子标记进行了蓖麻遗传多样性研究,并获得了一系列的指纹图谱,然而用TRAP标记进行相关研究还未见报道。【材料与方法】从NCBI(美国国家生物技术信息中心)获取蓖麻脂肪酸代谢相关EST(序列表达标签),设计TRAP引物,并对来自6个国家的52份代表性蓖麻材料基因组DNA进行PCR扩增;以用最少的引物区分最多的材料为原则,筛选出构建指纹图谱的核心引物;按照LDSS(最小距离逐步取样)策略,以30%的比例抽取16份具代表性材料构建指纹图谱。材料种子脂肪酸含量测定用NMI20-Analyst核磁共振成像分析方法;【结果与分析】共开发出34对TRAP引物,其中27对具有多态性,弓引物多态率为79.4%。多态性引物共扩增出77条带,其中多态性条带70条,多态性百分率为90.0%。每对引物能扩增出2～6条带,平均为2.85条,条带大小在200～2000bp之间。用5对核心引物构建了16份材料的指纹图谱,核心引物能将16份蓖麻材料区分为1～6个类型,平均为3.07个类型,且核心引物聚类结果与材料表型分类一致。【结论】用脂肪酸代谢相关EST开发的TRAP标记可用于蓖麻材料指纹图谱构建和脂肪酸含量辅助鉴定。此方法可以扩展到蓖麻其它性状的TRAP标记开发与辅助鉴定。更多还原