细鳞鱼和秦岭细鳞鱼线粒体全基因组

【作者】 司胜娟； 王莹； 徐革锋； 杨世勇； 牟振波； 宋昭彬；

【机构】 四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室； 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所； 四川农业大学水产系； 四川大学生命科学学院四川大学生物资源和生态环境教育部重点实验室；

【摘要】 细鳞鱼(Brachymystax lenok)和秦岭细鳞鱼(Brachymystax lenok tsinlingensis),均隶属于鲑形目(Salmoniformes),鲑科(Salmonidae),鲑亚科(Salmoninae),细鳞鱼属(Brachymystax)。秦岭细鳞鱼是细鳞鱼的一个亚种,为我国特有种,国家二级保护动物。目前细鳞鱼和秦岭细鳞鱼研究主要集中在资源调查、地理分布、生物学特征和生态习性等方面,而分子方面的研究极少涉及。为了进一步补充鲑亚科鱼类的线粒体基因组数据,并从线粒体基因组上分析细鳞鱼和秦岭细鳞鱼的亲缘关系。我们通过引物步移法测定了细鳞鱼和秦岭细鳞鱼的线粒体全基因组。细鳞鱼和秦岭细鳞鱼线粒体基因组全长分别为16,832 bp和16,669 bp。两个线粒体基因组中基因的排列,碱基组成和tRNA的二级结构,与大部分的硬骨鱼的是一致的。细鳞鱼和秦岭细鳞鱼线粒体基因组核苷酸序列的同源性为98.3%。通过两个细鳞鱼的线粒体基因组比较分析,我们发现它们线粒体基因的排布,组成和长度是相同的并且具有相等的A+T含量。同其他的淡水鲑科鱼类一样,在细鳞鱼和秦岭细鳞鱼的线粒体控制区也存在单碱基T微卫星和相似类型的82bp串联重复序列。依据重链编码的12个蛋白质基因计算出细鳞鱼和秦岭细鳞鱼两者之间的遗传距离为2.1%,显示了两者之间存在较近的亲缘关系。更多还原