SNP array在胎儿超声软指标异常产前诊断中的应用研究

【作者】 刘静； 王华； 贾政军； 席惠； 周玉春； 黄定梅； 彭向京；

【机构】 湖南省妇幼保健院医学遗传科；

【摘要】 目的:利用SNP array检测平台对B超发现的各系统畸形胎儿进行产前诊断,探讨胎儿畸形与CNVs的病因学关系,及时干预并预防出生缺陷患儿的出生。方法:收集2012年至今在湖南省妇幼保健院就诊的超声软指标异常(室间隔缺损、房间隔缺损、法洛氏四联症、内脏异构、侧脑室增宽、十二指肠梗阻、胎儿宫内发育迟缓、NT、NB增厚等)胎儿的样本共135例(其中羊水样本68例,脐带血样本67例),排除染色体水平可见的畸形后,抽取样本DNA并进一步行SNP array分型检测,得到异常CNVs后对其进行基因型与表型关系分析,结合Decipher数据库及GDV数据库,查询相关文献后探讨其致病性。结果:排除4例已知的染色体疾病后,SNP array检测发现18例样本存在阳性CNVs,其中9例重复型CNVs,4例缺失型CNVs,3例单亲二倍体,2例缺失合并重复型CNVs。重复片段大小在0.4.7~16.74Mb之间,缺失片段在0.16~13.3Mb之间。结合相关数据库及文献比对,3例为已知的微缺失/微重复综合征(其中2例为22q1 1.2微缺失,超声显示为VSD及F4),4例非明确遗传综合症区域的CNVs可能与表型相关,余11例为多态性CNVs。结论:本研究中通过SNP array高通量平台,异常CNVs的检出率为5.3%(7/131)。在产前诊断中,引入SNP array平台有利于发现更多未知的综合征型疾病,为遗传病诊断及咨询提供有力、可靠地依据。更多还原