鸡IGFBP2基因1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析

【作者】 于莹莹； 乔书培； 孙婴宁； 宋鹤； 张潇飞； 闫晓红； 李辉； 王宁；

【机构】 农业部鸡遗传育种重点实验室黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室东北农业大学动物科学技术学院； 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院；

【摘要】 鸡IGFBP2基因1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与肉鸡的腹脂重和腹脂率显著相关。该SNP位于IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR),生物信息学分析显示,该位点恰好位于gga-miR-456-3p的一个潜在靶基因结合区,提示该SNP位点可能是功能性SNP,它可能影响gga-miR-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用。为确认该SNP是否为功能性SNP,本研究分别构建了该SNP位点C和A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析了这两个等位基因在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;并利用miRNA mimics和inhibitor分析了gga-miR-456-3p对内源性IGFBP2的表达调控作用。结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性均显著高于C等位基因(P<0.05)。进一步的实验证实,gga-miR-456-3p调控IGFBP2基因的表达,且SNP(1196C>A)影响gga-miR-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用。本研究证实IGFBP2基因是gga-miR-456-3p的一个靶基因,而且其3′UTR区的1196C>A是一个功能性SNP。本研究对于鸡的分子辅助选择育种以及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义。更多还原