SSR标记与陆地棉纤维品质性状QTL的关联分析

【作者】 张素君； 唐丽媛； 江振兴； 刘存敬； 李兴河； 张香云； 张建宏；

【机构】 河北省农林科学院棉花研究所/农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室/国家棉花改良中心河北分中心； 河北行政学院；

【摘要】 选取214份陆地棉代表性资源材料组成关联群体,对其纤维品质(纤维长度、断裂比强度、长度整齐度指数、马克隆值和断裂伸长率)进行3年7个环境的表型鉴定,构建其纤维品质表型数据库,选用在棉花基因组上均匀分布多态性较好的242个SSR标记对供试群体进行全基因组扫描,共检测到286个多态性位点,涉及704个等位变异。利用Structure软件对群体进行结构分析,采用Tassel软件中GLM(Q)方法将供试群体纤维品质在7个环境下的表型数据和SSR标记位点进行关联分析。结果表明:供试群体被基因型数据划分为2个亚群,通过关联分析,在不同环境中发掘与纤维品质性状极显著关联(P<0.01)的SSR位点134个,其中有13个位点在3个环境(年份)重复检测到,13个位点在4个环境(年份)重复检测到,2个位点在6个环境(年份)重复检测到,有3个位点(NAU6177,DPL0886,NAU3607)在7个环境中均检测到。与纤维长度极显著相关(P<0.01)的位点有22个,其中6个位点在4个环境中重复检测到,表型变异解释率最高为NAU6177,达12.45%;与断裂比强度极显著相关(P<0.01)的位点有23个,其中NAU6177在7个环境中重复检测到,表型变异解释率最高达11.14%;与马克隆值极显著相关(P<0.01)的位点有39个,DPL0886在7个环境中重复检测,表型变异解释率最高为8.25%;与断裂伸长率极显著相关(P<0.01)的位点有27个,表型变异解释率最高为NAU3607(7个环境),达13.99%;与长度整齐度指数极显著相关(P<0.01)的位点有23个,4个位点在2个环境中检测到。这些在不同环境中稳定存在的SSR标记位点经验证后可用于陆地棉纤维品质育种分子辅助选择。此外,创制筛选12个纤维品质优异的株系,挖掘携带优异等位变异的典型材料2份,为陆地棉分子育种和种质创新提供有益信息。更多还原