背膘极端表现猪脂肪和肝脏组织的表达谱分析

【作者】 邢凯； 侯卓成； 王晓铄； 季涛； 王楚端；

【机构】 中国农业大学动物科学技术学院畜禽育种国家工程实验室； 天津市宁河原种猪场；

【摘要】 引言脂肪沉积性状是猪的最重要的经济性状之一,体内脂肪沉积的多寡直接影响猪胴体品质、肉品质等肉用经济价值,而肝脏在动物体内脂肪代谢调控中起着十分关键的作用。本研究通过对长白猪、松辽黑猪的脂肪和肝脏组织中的RNA测序,从而筛选出背膘厚极端表型个体间的差异基因。材料方法对相同饲养条件下的85~115kg的松辽黑猪、长白猪母猪的背膘厚进行测定,并校正到100kg背膘厚。每个品种各选取三对极端个体进行屠宰取样,液氮保存。提取12个个体脂肪组织和8个个体肝脏组织中的RNA进行高通量测序。测序结果与参考基因组进行比对并找出差异基因(Fold change>1.5,P<0.05)。将其在DAVID网站上进行GO分析和Pathway分析。结果在3对长白猪全同胞中,厚背膘的个体比薄背膘的个体脂肪组织中上调控的差异表达基因分别为1344、3948、454个,其中共同高表达基因为48个;下调控表达的差异基因分别为708、3414、327个,其中共同低表达基因为41个。肝脏组织中上调控的差异表达基因分别为537、1561个,其中共同高表达基因为241个;下调控表达的差异基因分别为329、1379个,其中共同低表达基因为90个。同样,3对松辽黑猪个体脂肪组织中上调控的差异表达基因分别为621、874、885,其中共同高表达基因为67个;下调控表达的差异基因分别为921、721、1003个,其中共同低表达基因为52个。肝脏组织中上调控的差异表达基因分别为650、586个,其中共同高表达基因为50个;下调控表达的差异基因分别为210、793个,其中共同低表达基因为33个。分析后找到了多条与脂肪代谢相关的过程和通路。讨论在脂肪沉积不同水平中,有多个调节脂肪代谢的基因的表达发生变化。结合已有的文献报道,初步找到多个重要调控脂肪沉积的基因和通路。本研究己对实验个体重测序,并进一步验证基因功能。更多还原