利用全基因组关联分析及连锁作图法挖掘抗大豆菌核病位点及候选基因

【作者】 赵雪； 韩英鹏； 赵月； 吕春梅； 李冬梅； 滕卫丽； 李文滨；

【机构】 大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室东北农业大学；

【摘要】 大豆菌核病(Soybean white mold,SWM)由核盘菌引起,是造成大豆产量严重损失第二大病害。因此,在大豆的育种工作中鉴定抗菌核病大豆种质资源,深入理解抗大豆菌核病的分子遗传机制显得十分重要。经过草酰乙酸处理后的茎中可溶性色素量是识别大豆SWM抗性的一个有效指标。本研究利用抗SWM的大豆品种‘Maple Arrow’与感病大豆品种‘合丰25’杂交衍生的128个重组自交系群体和330个栽培大豆为实验材料,分析了经草酰乙酸处理后的大豆茎中的可溶性色素的含量,利用连锁分析的方法定位出4个与大豆茎中可溶性色素含量相关的QTL位点。同时,对330个栽培大豆品种进行了简化基因组测序分析,获得25,179个多态性SNP位点,进一步利用其进行全基因组关联分析,获得4个抗SWM的关联位点。研究发现,通过关联分析的方法可识别出更多控制该病害的QTL位点,其中位于13个号染色体上的一个主效QTL能同时被连锁分析和关联分析两种方法检测到,在该位点(<60 kbp)内存在4个与疾病应答或花青素合成途径相关的潜在候选基因。本研究挖掘得到的优异SNP等位变异和抗病候选基因为今后的大豆抗SWM分子辅助育种工作提供了有益参考。更多还原