变异型PRRSV-FJ09A株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析

【作者】 王隆柏； 车勇良； 吴学敏； 陈如敬； 刘玉涛； 魏宏； 庄向生； 周伦江；

【机构】 福建省农业科学院畜牧兽医研究所； 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心；

【摘要】 为了解PRRSV-FJ09A福建分离毒株的变异情况,采用RT-PCR方法,对该毒株的ORF5与NSP2基因组进行了遗传变异分析。结果:与PRRSV-VR2332标准毒株比较,基因片段变异程度较大,ORF5的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为87.6%和88.1%,存在多个氨基酸发生突变,主要集中在抗原表位、毒力相关位点和糖基化位点序列中;NSP2基因的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为80.9%和77.0%,分3处共缺失了31个氨基酸,比国内其他报道变异型PRRSV毒株多1处缺1个苯丙氨酸(F)。比较国内2006年后流行的变异型PRRSV毒株,PRRSV-FJ09A毒株ORF5的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为98.5%-99.7%和97.5%-99.5%,NSP2基因的核苷酸及推导的氨基酸的同源性分别为98.4%-99.3%和97.3%-98.9%。遗传进化树表明:PRRSV-FJ09A毒株为美洲型毒株,与国内流行的变异型PRRSV-FJ06A毒株的亲缘关系比较近。更多还原