花椰菜遗传图谱的构建及重要农艺性状的定位

【作者】 于雪梅； 江汉民； 王春国； 陈成彬； 孙德岭； 宋文芹；

【机构】 南开大学生命科学学院； 天津科润蔬菜研究所；

【摘要】 花椰菜（Brassica oleracea var.botryis）,是十十字花科（Cruciferae）芸薹属（Brassica）甘蓝种中以花球为产品的一个变种,是我国栽培面积较大的蔬菜作物之一,具有重要的营养价值和经济价值,因此构建一张较高密度的永久性分子遗传图谱具有重要意义。本研究利用性状差异显著的花椰菜父本（CH013）和母本（CH015）杂交获得的F1代,经小孢子培养技术构建了DH群体ZH1-90,该群体包含90个株系,经检测可以用于构建图谱的株系65株。利用SRAP、SSR两种分子标记进行遗传分析。筛选了确定了83对正反向SRAP引物组合和56对SSR引物组合,共检测到SRAP多态性条带263条,平均3.2条多态性条带/引物对。在获得的263个多态性位点中,有95个位点偏离孟德尔理论分离比率1:1,占36.1%。共检测到SSR多态性条带52条,平均0.9条多态性条带/引物对。在获得的52个多态性位点中,有24个位点偏离孟德尔理论分离比率1:,占46.2%。利用软件Joinmap3.0对筛选出的315个多态性标记（包括263个SRAP标记,52个SSR标记）进行连锁分析,得到一张包含9个连锁群的花椰菜遗传连锁图谱。连锁图含有292个多态性标记,其中有243个SRAP标记（20个未连锁标记）,连锁标记比率为92.4%;49个SSR标记（3个未连锁标记）,连锁标记比率为94.2%。连锁群覆盖751Cm,共287个位点,每个连锁群长度范围在47～123cM之间,每个连锁群的标记数由22～48个组成,相邻标记间的平均图距为2.6cM。针对花椰菜不同农艺性状差异显著的5组植株（五组性状如下:花球色,早晚熟,蜡质,梗长,缺刻叶）。根据每组植株的SSR扩增结果,筛选差异标记。将花球颜色这一性状的7个相关SSR标记定位于于1、2、4连锁群上,早晚熟性状的5个SSR标记定位于3、6、7连锁群上。3个蜡质相关标记均定位于5号连锁群上。与缺刻叶相关的4个标记定位于1、3、4连锁群。与梗的长短相关的3个标记定位于5、6连锁群。这5组性状的相关分子标记均未分布在8、9连锁群上,这可能与构建该两个连锁群的SSR标记过少有关。本研究构建的遗传图谱与古瑜（2007）以花椰菜F₂代作图群体构建的分子遗传图谱比较,平均图谱密度提高了0.3cM,但依然存在分子标记分布不够均匀的现象,其主要原因在于双亲间存在多态性的SSR标记数目太少,同时SSR标记在本研究中的作图效率又较低,达不到理论上对数目的要求,因此还有待于进一步利用其他的分子标记如AFLP分子标记,将其扩增筛选出的多态性标记整合到该图谱中增加遗传图的密度。更多还原