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中国牛病毒性腹泻病毒JZ05-2分离株全基因测序及分析

Genome Sequencing and Analysis of the Bovine Viral Diarrhea Virus-2 Strain JZ05-2 Isolated in China

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【作者】 李庆超； 苗利光； 李海涛； 刘艳环； 肖佳美；

【Author】 LI Qing-chao MIAO Li-guang~* LI Hao-tao LIU Yan-huan XIAO Jia-mei (Institute of Special Wild Economic Animal and Plant Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Jilin,132109)

【机构】 中国农业科学院吉林特产研究所；

【摘要】 牛病毒性腹泻病毒为瘟病毒属成员,呈世界性分布且造成乳/肉牛业严重经济损失。本研究利用MDBK细胞增殖一株分离于我国吉林地区的牛源牛病毒性腹泻病毒JZ05-2毒株,观察发现具有典型的致细胞病变效应。用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)分别扩增覆盖基因组全长的八个片段并测序,拼接获得该病毒的全基因序列长12285核苷酸(nt),GenBank登陆号:GQ888686。该病毒基因组具有一个11691 nt开放读码框编码多聚蛋白,5’-UTR长387 nt、3’-UTR长207 nt。对BVDV-2JZ05-2的5’-UTR和全基因序列进行分析,发现该病毒为BVDV-2a1亚型。BVDV-2型多数毒株之间相似性约为96%,与JZ05-2全基因组序列相似性最高的美国p11Q毒株和中国XJ-04毒株分别为90%和91%。因此,JZ05-2全基因组序列与BVDV-2型其他毒株序列具有较大差异。

【关键词】 BVDV； 全基因组； 基因型； 相似性；
  • 【会议录名称】 2010中国鹿业进展
  • 【会议名称】首届中国鹿业发展大会暨中国畜牧业协会鹿业分会成立大会
  • 【会议时间】2010-08-28
  • 【会议地点】中国内蒙古包头
  • 【分类号】S852.65
  • 【主办单位】中国畜牧业协会
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