毛果杨全基因组NBS类型抗病基因分析

【作者】 吴大强； 项艳；

【机构】 安徽农业大学林学与园林学院；

【摘要】 本研究对毛果杨(Populus trichocarpa(Torr.& Gray))中含有核苷酸结合区(NBS)结构的候选抗病基因进行了全基因组的分析研究,包括NBS类型基因总量的确认、类型分析、物理位置分布和系统发生学关系分析等。研究结果表明,在毛果杨全基因组中共有381个有NBS结构的基因,按照N端结构和亮氨酸富集区(LRRs)结构的区别分为122个非标准结构NBS基因、259个标准结构NBS基因,其中标准类基因又分为13个小类,主要包括TNL、CNL、NL、XNL、TN五大类型和其他一些小类。同时,研究发现81.9%的NBS基因分布在一定的簇内,并且81.8%的基因簇存在复制现象,说明毛果杨基因组中抗病基因在进化过程中存在较多的复制现象。通过对基因组内标准NBS基因进行系统进化树分析,抗病基因进化树呈星状拓扑结构,按照30%的核苷酸差异度划分,NBS类型基因共存在着68个分组。更多还原