毛白杨基因组内转录区域遗传杂合水平估算

【作者】 李博； 江锡兵； 王泽亮； 张志毅；

【机构】 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室；

【摘要】 分子标记技术的迅速发展,为研究林木基因组遗传结构提供了重要手段。cDNA-AFLP标记技术是一种高效和稳定的研究基因表达差异的方法,同时由于该标记技术可以反映不同个体间的转录物组之间的差异,也被当作一种遗传分析手段应用在遗传作图上。毛白杨是我国重要的乡土树种之一,在我国的林业建设和林业经济生产中发挥着重要作用。本研究首次利用cDNA-AFLP技术对毛白杨及毛新杨基因组转录区多态性水平和遗传杂合水平进行分析。结果显示:47对引物一共获得清晰可读条带1564条,多态性标记307个,标记平均多态性水平为19.6%,不同引物之间差异明显,多态性最高的引物组合是E_ATC/M_CA,多态性标记为15个,多态性最低的是E_GAA/M_TA,多态性标记仅为3个。与整个基因组相比,转录区内的多态性水平为整个基因组多态性水平的71.5%。利用这些引物,对毛新杨×毛白杨回交群体进行分析,估算出毛白杨及其杂种毛新杨基因组转录区内的平均遗传杂合水平分别为12.47%和7.16%,毛白杨是毛新杨的1.74倍。与整个基因组的遗传杂合水平相比,转录区杂合程度显著降低,毛白杨降低了33.4%,毛新杨降低了15.5%,可能是由于该区域受到更强的选择压力,导致转录区内的变异程度显著下降。本研究为进一步了解毛白杨基因组内转录区遗传结构提供了重要信息,并为针对杨树基因组结构分析奠定了基础。基因组内转录区的遗传杂合水平反映了等位基因杂合程度,而等位基因的杂合程度与杂种优势密切相关,研究最后对利用转录区内遗传杂合程度研究杨树杂种优势可行性进行了探讨。更多还原