结肠腺瘤-正常文库的分析

【作者】 徐静； 吕炳建； 张昊； 罗敏捷； 来茂德；

【机构】 浙江大学医学院病理学与病理生理学系； 浙江大学计算机科学与技术学院计算机系；

【摘要】 目的系统分析结肠腺瘤相对正常结肠黏膜抑制性差减杂交(SSH)文库(A-N),获取差异基因表达谱,阐明结直肠癌发生发展的分子机制,寻找肿瘤早期诊断的分子标志物。方法自行开发软件、搭建了物信息学分析平台。利用该平台 A-N 文库中109个差异表达克隆进行分析、获取差异表达基因,进行 Gene Ontology 基因分类, 并对9个基因在8例结肠腺瘤,49例结肠癌和其匹配的正常黏膜中进行 Realtime-PCR 验证。结果 REG4、PERP 在7/8,6/8例腺瘤相对正常黏膜高表达,差异有统计学显著性(P<0．05,Wilcoxon 检验)；14-3-3 zeta 在5/8例腺瘤中高表达,但无统计学意义。PERP 在39/49例腺癌中、14-3-3 zeta 在31/49例腺癌中表达较正常显著性高表达(P< 0．05,Wilcoxon 检验)。6个核糖体蛋白(RP)基因中有3个在5/8以上腺瘤中较正常表达上调,5 个在半数以上的腺癌中表达较正常下调,且 RPL5, RPL10a 在腺癌中的低表达有统计学意义(P< 0．01,Wilcoxon 检验)。RP 聚类分析发现核糖体蛋白基因在腺瘤中富集程度显著性大于腺癌(P= 0．020,x2检验)。结论 REG4,PERP,14-3-3 zeta 等差异表达基因可能是结肠肿瘤早期诊断潜在标志物,核糖体蛋白基因富集是结肠腺瘤发生常见分子生物学事件。更多还原