节点文献
结合多种数据源的功能模块分析
【机构】 首都医科大学生物医学工程学院；
【摘要】 基因型与表型间的相关关系研究是生物信息学中的一个热点问题。本文通过基因表达差异值和IBD值对单核苷酸多态位点(SNP)和基因之间的相关关系进行了分析。通过t值对SNP和基因对间的相关系进行评价,并找到了大量SNP-GENE相关对。通过进一步的层次聚类分析,得到了基因和SNPs模块,利用染色体定位信息,功能知识体系信息及蛋白质互作信息对这些模块分析后发现,它们具有显著的功能富集和染色体位置富集的现象。
【关键词】 基因表达谱；
单核苷酸多态性(SNP)；
IBD；
蛋白质互作；
Gene Ontology；
模块；
【基金】 国家自然科学基金(批准号:30571034,30370798);2006年北京市新世纪百千万人才工程;北京市教育委员会科技发展计划(批准号:KM20060025011)等项目资助
- 【会议录名称】 中国生物医学工程进展——2007中国生物医学工程联合学术年会论文集（下册）
- 【会议名称】2007中国生物医学工程联合学术年会
- 【会议时间】2007-04
- 【会议地点】中国陕西西安
- 【分类号】R319
- 【主办单位】中国电子学会生物医学电子学分会、中国生物医学工程学会生物医学测量分会、中国生物医学工程学会生物信息与控制分会、中国生物医学工程学会生物医学传感器技术分会