表皮葡萄球菌ATCC35984的表达谱研究

【作者】 李娜； 杨晓梅； 瞿涤； 杨芃原；

【机构】 复旦大学化学系； 复旦大学医学院分子病毒所；

【摘要】 <正> 最近,文献公开报道了ATCC35984的基因组。基因组研究预测出表皮葡萄球菌ATCC35984含有2553个蛋白。由于在生物体中行使功能的是蛋白质而不是基因,因此蛋白质组学的研究更能反映生物体的真实面目。相对于比较蛋白质组学,全蛋白表达谱的研究更有助于深入了解某个特定的生物体系。本文利用三种不同的蛋白质组学技术路线研究了ATCC35984的全蛋白表达谱。这三种路线包括:2DE-MALDI-TOF-MS/MS,1D-RP-HPLC-ESI-MS/MS以及1DE-HPLC-ESI-MS/MS。同时,利用三种不同的蛋白提取方法提取了细菌的全蛋白,难溶性蛋白和分泌性蛋白。结果表明,这些技术和提取方法相结合有助于鉴定更多的蛋白。我们一共鉴定了885种蛋白,其中140种蛋白是三种技术共同鉴定的,同时每一种技术也分别鉴定了一定数目的蛋白。基于实验结果,一些和形成生物膜相关的蛋白以及新蛋白被发现,上述结果对于深入了解在ATCC35984中生物膜的形成过程中,蛋白质是如何行使功能具有重要意义。更多还原