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用正交设计优化荔枝RAPD反应体系

Optimization of the RAPD Reaction System of Litchi chinensis Sonn. by Orthogonal Design

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【作者】 王家保刘志媛徐碧玉邓穗生杜中军陈业渊

【Author】 Wang Jiabao Liu Zhiyuan Xu Biyu Deng Suisheng Du Zhongjun Chen Yeyuan (1 Institute of Tropical Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences Haikou,Hainan,571101; 2 College of Horticulture, South China University of Tropical Agriculture, Danzhou, Hainan,571737; 3 Institute of Tropical Crop Germplasm, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences, Danzhou, Hainan, 571737)

【机构】 中国热带农业科学院热带生物技术研究所华南热带农业大学园艺学院中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

【摘要】 以改良CTAB 法提取的荔枝基因组DNA 为模板,应用L25(56)正交表,研究了Taq、Mg2+、随机引物、dNTPs 和DNA模板五种RAPD 反应组分浓度变化对扩增结果的影响,量化分析结果表明:正交设计可以应用于RAPD 反应体系的建立。用这种方法建立的荔枝RAPD-PCR 优化反应体系为:为25μl 反应体系中,含1×buffer、2.0mM Mg2+、2.0UTaqDNA 聚合酶、0.15mMdNTPs、0.6 M随机引物、25ngDNA 模板。

【Abstract】 The L25(56) orthogonal diagram was applied to study the effects of different Taq polymerase, Mg2+, dNTPs, primer and DNA concentration on litchi(Litchi chinensis Sonn.) RAPD-PCR results and to get a suitable PCR system. The results showed that the orthogonal design could be used to optimize the RAPD-PCR system. A suitable RAPD reaction system for litchi developed by orthogonal design was 1× Taq polymerase reaction buffer, 2.0mM Mg2+, 2.0U TaqDNA polymerase, 0.15mMdNTPs, 0.6 primer and 25ng genomic DNA templates with total 25μl reactionM solution.

【关键词】 荔枝RAPD正交设计
【Key words】 LitchiRAPDOrthogonal design
【基金】 海南省自然基金立项项目(项目编号:30236)。
  • 【会议录名称】 中国热带作物学会第七次全国会员代表大会暨学术讨论会论文集
  • 【会议名称】中国热带作物学会第七次全国会员代表大会暨学术讨论会
  • 【会议时间】2004
  • 【分类号】S667.1
  • 【主办单位】中国热带作物学会
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