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用正交设计优化荔枝RAPD反应体系
Optimization of the RAPD Reaction System of Litchi chinensis Sonn. by Orthogonal Design
【作者】 王家保; 刘志媛; 徐碧玉; 邓穗生; 杜中军; 陈业渊;
【Author】 Wang Jiabao Liu Zhiyuan Xu Biyu Deng Suisheng Du Zhongjun Chen Yeyuan (1 Institute of Tropical Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences Haikou,Hainan,571101; 2 College of Horticulture, South China University of Tropical Agriculture, Danzhou, Hainan,571737; 3 Institute of Tropical Crop Germplasm, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences, Danzhou, Hainan, 571737)
【机构】 中国热带农业科学院热带生物技术研究所; 华南热带农业大学园艺学院; 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;
【摘要】 以改良CTAB 法提取的荔枝基因组DNA 为模板,应用L25(56)正交表,研究了Taq、Mg2+、随机引物、dNTPs 和DNA模板五种RAPD 反应组分浓度变化对扩增结果的影响,量化分析结果表明:正交设计可以应用于RAPD 反应体系的建立。用这种方法建立的荔枝RAPD-PCR 优化反应体系为:为25μl 反应体系中,含1×buffer、2.0mM Mg2+、2.0UTaqDNA 聚合酶、0.15mMdNTPs、0.6 M随机引物、25ngDNA 模板。
【Abstract】 The L25(56) orthogonal diagram was applied to study the effects of different Taq polymerase, Mg2+, dNTPs, primer and DNA concentration on litchi(Litchi chinensis Sonn.) RAPD-PCR results and to get a suitable PCR system. The results showed that the orthogonal design could be used to optimize the RAPD-PCR system. A suitable RAPD reaction system for litchi developed by orthogonal design was 1× Taq polymerase reaction buffer, 2.0mM Mg2+, 2.0U TaqDNA polymerase, 0.15mMdNTPs, 0.6 primer and 25ng genomic DNA templates with total 25μl reactionM solution.
- 【会议录名称】 中国热带作物学会第七次全国会员代表大会暨学术讨论会论文集
- 【会议名称】中国热带作物学会第七次全国会员代表大会暨学术讨论会
- 【会议时间】2004
- 【分类号】S667.1
- 【主办单位】中国热带作物学会