造血干细胞中特异表达新基因kd93的重组表达和晶体结构研究

【作者】 刘俊峰； 王新泉； 三占新； 江涛； 安晓敏； 常文瑞； 梁栋材；

【机构】 中国科学院生物物理所生物大分子国家实验室；

【摘要】 来源于造血干细胞中特异表达的开放阅读框架HSPCO31(Genbank登录号:AFO85360)推测编码的蛋白质是酵母的NIP7同源蛋白,属于一个结构和功能未知的蛋白质家族UFP00113。利用多波长反常散射技术解析了这个蛋白质1.9-A分辨率的晶体结构。这个蛋白质晶体结构的分析表明,Kd93的整体结构是由两个α/β交连的结构域组成。利用DALI程序在PDB库中查询同源结构时,发现这一结构的C结构域与一些RNA修饰酶尤其是tRNA鸟嘌呤糖基转移酶的RNA结合区域高度同源,表明Kd93可能与RNA结合有关;但是Kd93与tRNA鸟嘌呤糖基转移酶在RNA结合区域的对应残基的种类和表面电位存在显著不同,所以它们可能具有不同的RNA结合模式。未发现与N结构域同源的结构。Kd93结构的解析为了解NIP7及其它属于UFP00113家族成员的功能提供了很好的结构基础。更多还原