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高粱PLC基因家族全基因组鉴定及其对非生物胁迫的响应表达分析
Whole genome identification of PLC gene family in sorghum and its expression in response to abiotic stress
【摘要】 磷脂酶C(PLC)是磷酸肌醇代谢中重要的水解酶之一,在调节植物生长发育、应对逆境胁迫和多种信号转导过程中发挥着重要功能。鉴定高粱的PLC基因家族,能够为磷脂酶C基因功能研究提供理论依据,有利于筛选出植物抗逆发育生长的有效基因。基于高粱全基因组数据,鉴定得到高粱PLC基因家族,通过生物信息学方法分析并研究高粱PLC基因家族成员的理化性质、染色体定位、基因结构、保守结构域、顺式作用元件、共线性关系和系统发育关系,并用qRT-PCR技术探究高粱PLC基因家族在不同组织时期、胁迫处理下的表达模式。结果表明,共鉴定到11个SbPLC基因,分为2个亚家族,各亚家族内的SbPLC具有典型的蛋白基序和基因结构特征,在一定程度上支持分类预测。此外,这11个SbPLC基因在高粱的6条染色体上不均匀分布并且均富集了生长发育、激素响应相关的顺式元件。通过对SbPLC共线性关系的研究发现,基因复制事件可能导致一些SbPLC基因的产生,片段复制比串联重复更有助于SbPLC基因家族的扩展。qRT-PCR结果显示,SbPLC基因不同程度地受到非生物胁迫的影响,并且在花器官、种子中的表达相对活跃。综上所述,本研究结果和信息为进一步研究高粱PLC基因的生物学功能和进化提供了良好基础,同时也为高粱的抗逆性分子育种提供了一些候选基因。
【基金】 贵州省科技计划(编号:黔科合支撑[2022]重点026);贵州省十大工业(优质烟酒)产业振兴专项资金(编号:黔财工[2020]198);贵州省省级绿色高产高效建设项目(编号:S2023-002)
- 【文献出处】 江苏农业科学 ,Jiangsu Agricultural Sciences , 编辑部邮箱 ,2024年23期
- 【分类号】S514
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