节点文献

百合斑驳病毒大连分离物基因组全序列测定及其分析

Lily Mottle Virus Genome of Dalian Isolates Sequencing and Its Analysis

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 徐品三孙冰轮姜旭李焕改

【Author】 XU Pin-san;SUN Bing-lun;JIANG Xu;LI Huan-gai;School of Life Science and Biotechnology,Dalian University of Technology;Graduate School of Agricultural and Life Sciences,University of Tokyo;

【机构】 大连理工大学生命科学与技术学院东京大学农学生命科学研究科

【摘要】 根据GenBank上已登录的百合斑驳病毒(LMoV)基因组序列设计7对交叉重叠的引物,利用RT-PCR技术对铁炮百合白天堂进行检测,并经克隆测序获得百合斑驳病毒大连分离物(LMoV-DL)基因组全序列。序列分析表明:LMoV基因组由长度为9 648 bp的线状单链正义RNA组成,包括一个poly(A)尾巴,编码一个由3 096个氨基酸组成的分子量为351 kDa的多聚蛋白。同时多聚蛋白系统发育分析说明LMoV隶属于Potyvirus属一个较大的分支,在进化关系上与BYMV和ClYVV最近。

【Abstract】 According to Lily mottle virus( LMoV) genome sequence logged in the GenBank,we seven pairs of overlapping primers,and use RT-PCR technique to detect Lilium longiflorum White Heaven,then obtain the wholegenome sequences of Lily mottle virus of Dalian isolates( LMoV-DL) by cloning and sequencing. Through the sequence analysis indicates that: LMoV genome is the linear positive-sense single-stranded RNA which is constituted with the length of 9 648 bp,comprising a poly( A) tail and encoding a molecular weight of 351 kDa poly-protein which is composed of 3 096 amino acids. Poly-protein phylogeny analysis that the LMoV is a large branch of Potyvirus and close to BYMV and ClYVV on the evolutionary relationship.

【基金】 国家自然科学基金资助项目(31070621)
  • 【文献出处】 华北农学报 ,Acta Agriculturae Boreali-Sinica , 编辑部邮箱 ,2013年S1期
  • 【分类号】S436.8
  • 【被引频次】10
  • 【下载频次】106
节点文献中: