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三维原子场全息作用矢量用于HETP类抗艾滋病类药物活性定量构效关系研究

QSAR studies of HETP anti-HIV drug using three-dimensional holographic vector of atomic interaction field (3D-HoVAIF)

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【作者】 王娇娜; 梅虎; 龙海; 张巧霞; 李志良;

【Author】 Wang Jiaona~(1,2) Mei Hu~1 Long Hai~2 Zhang Qiaoxia~1 Li Zhiliang~1 1.College of Chemistry and Chemical Engineering,Chongqing University,Chongqing,400044,China; 2.Chongqing Academy of Metrology and Quality Inspection,Chongqing,400020,China

【机构】 重庆大学化学化工学院; 重庆市计量质量检测研究院; 重庆大学化学化工学院 重庆; 400044 重庆市计量质量检测研究院; 重庆; 400044;

【摘要】 定量构效关系为药物设计和筛选提供相对简便途径并受到广泛重视。为更好模拟药物结构与活性间相关性,尝试采用本实验室新近提出三维原子场全息作用矢量,基于三种经典原子间静电、立体和疏水即非键作用方式,不借助任何实验参数对35个HETP类抗艾滋病药物进行定量活性构效关系。模型估计和交互校验复相关系数和标准偏筹分别为Rcu2=0.882、Q?2 =0.812与RMSEE=0.43。模型具良好稳定性和预测力,表明此矢量在分子结构表征和生物活性预测的适应性。

【Abstract】 Quantitative Structure-Activity Relationship(QSAR),which investigates the quantitative relationship between the molecular structural parameters and biological activities or dependent functions,is one of the most important fundamental fields in pure and ap- plied chemistry and pharmacy.In this paper,a newly developed three-dimensional holographic vector of atomic interaction field(3D- HoVAIF)was used to describe the chemical structure of anti-HIV drug-35 HETP.The cumulative multiple correlation coefficient (Rcu2),cumulative cross-validated(Qcu2)and root mean square error of estimation(RMSEE)for the training set are Rcu2=0.882,Qcu2 =0.812 and RMSEE=0.43 respectively,which are all better than correlative report.The model has favorable stability and good pre- diction capabilities and the 3D-HoVAIF is applicable to the molecular structural characterization and biological activity prediction.

【基金】 国家“春晖计划”教育部启动基金[99-1-5+4-6];重庆市应用基础基金[01-3-6];重庆大学科技攻关创新项目资助课题[03-5-8]
  • 【文献出处】 计算机与应用化学 ,Computers and Applied Chemistry , 编辑部邮箱 ,2007年02期
  • 【分类号】R96
  • 【被引频次】8
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