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应用微卫星对白念珠菌种内分型

Study on the genotyping of Candida albicans by microsatellite assay

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【作者】 高飞施伟民陈德利沈亮亮邸玉君霍克克

【Author】 Gao Fei,Shi Weimin,Chen Deli,et al.Department of Dermatology and Venereology,Yunnan First People Hospital,Kunming,650032

【机构】 云南省第一人民医院皮肤科同济大学附属同济医院皮肤科复旦大学基因工程国家重点实验室复旦大学基因工程国家重点实验室 昆明650032

【摘要】 目的:用rDNA以外的重复序列(微卫星)对白念珠菌进行种内分型。方法:选取临床分离株20株以及标准株1株,设计针对保守基因CDC3的引物进行PCR,PCR产物连接到载体,转化,然后测序和分型。结果:21株菌株依微卫星型别被分为5种基因型,依片段长度型别分为7型。2株临床分离株和1株标准株经转种10次以后基因型仍然保持稳定。结论:CDC3中的微卫星遗传稳定,可以作为基因分型标记。用该方法可以进行白念珠菌种内分型,将为开展白念珠菌病流行病学调查提供一个方法。

【Abstract】 Objective: To find a way for strain identification of Candida albicans(C.albicans) by repeat sequence(microsatellite),which came from other gene except for rDNA.Methods: Twenty strains were sampled from outpatient and 1 standard strain was selected.By using the primer designed for CDC3 PCR was performed,cloning the amplification products and analyzing them after auto-sequencing.Results: Five genotypes by microsatellite and 7 genotypes by length of amplification products were differentiated among 21 strains.The genotype of 3 strains kept stable after subculture 10 times.(Conclusion): The microsatellite inheritance of CDC3 is stable,which can be used for molecular marker and provide a method to study epidemiology of C.albicans.

【关键词】 白念珠菌基因型微卫星
【Key words】 Candida albicansgenotypemicrosatellite
  • 【文献出处】 中国麻风皮肤病杂志 ,China Journal of Leprosy and Skin Diseases , 编辑部邮箱 ,2006年07期
  • 【分类号】R379
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