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基因表达谱芯片筛选局灶性脑缺血大鼠脑相关基因的研究

Cortical gene expression pattern in rat focal cerebral ischemia

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【作者】 张占军； 应康； 王忠； 张小燕； 刘建勋； 黄燕； 徐立； 魏翠娥； 王永炎；

【Author】 ZHANG Zhan-jun~1, YING Kang~2, WANG Zhong~3, ZHANG Xiao-yan~4, LIU Jian-xun~3, HUANG Yan~2, XU Li~3, WEI Cui-e~3, WANG Yong-yan~5(~1The Clinical School of Beijing University of Traditional Chinese Medicine, Beijing 100029, China;?~2?The Academy of Shanghai Lian He Gene Group, Shanghai 200000, China;?~3?Xi Yuan Hospital of The Academe of Traditional Chinese Medicine, Beijing 100091, China;?~4?Beijing Normal University, Beijing 100037, China;?~5?The Academy of Traditional Chinese Medicine, Beijing 100089, China)

【机构】 北京中医药大学临床医学院； 上海联合基因集团研究院； 中国中医研究院西苑医院； 北京师范大学生命科学院； 中国中医研究院 北京100029； 上海200000； 北京100091； 北京100037； 北京100089；

【摘要】 目的 :应用基因芯片技术研究局灶性脑缺血大鼠脑组织与假手术组大鼠脑组织基因表达谱的差异 ,探索局灶性脑缺血的发病机制。方法 :将 4 0 96种大鼠基因PCR产物用CartesianPixsys 75 0 0点样仪按微矩阵排列制成基因芯片 ;按一步法抽提脑局灶性缺血大鼠脑组织与假手术组大鼠脑组织的总RNA ;将等量的脑局灶性缺血大鼠脑组织与假手术组大鼠脑组织RNA分别逆转录合成以Cy5和Cy3标记的cDNA一链做探针 ,混合后与上述基因芯片杂交。用AxonGenepix 4 0 0 0B扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,用GenepixPro4 .0软件进行数字化处理和分析后比较两种组织基因表达谱的差异。结果 :局灶性脑缺血大鼠与假手术组大鼠脑组织基因表达谱分析 ,发现 2 11个差异表达基因 ,其中 12个基因低表达 ,199个基因高表达。结论 :本研究从脑局灶性缺血大鼠脑组织中筛选出大量的差异表达基因 ,说明这些基因可能参与局灶性脑缺血后脑损伤的发生及发展过程 ,从而为局灶性脑缺血的诊治提供新思路

【Abstract】 AIM: To investigate the genes differential expression in cortex during rat focal cerebral ischemia. METHODS: cDNA microarray chips containing numerous cDNAs were used to investigate the gene expression pattern between samples of focal cerebral ischemia and sham-control operation rats. RESULTS: Two hundred and eleven genes differentially expressed were screened out, among these genes, up-and down-regulated genes were 199 and 12, respectively. CONCLUSIONS: The analysis of gene expression pattern of focal cerebral ischemia based on cDNA microarray can realize high-throughput screening of the genes associated with the focal cerebral ischemia. The differential expression of genes may be related to the pathogenesis of focal cerebral ischemic diseases.

【关键词】 脑缺血； 基因表达谱； 寡核苷酸序列分析； 大鼠；
【Key words】 Brain ischemia； Gene expression profiling； Oligonucleotide array sequence analysis； Rats；
【基金】 国家 973重点基础研究发展规划项目 (No .G19990 5 5 4 - ) ;国家中医药管理局课题 (2 0 0 0 -B -J- 16 )
  • 【文献出处】 中国病理生理杂志 ,Chinese Journal of Pathophysiology , 编辑部邮箱 ,2004年08期
  • 【分类号】R743
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】203
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