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鸡传染性法氏囊病病毒超强毒上海株SH95基因组B片段的克隆与分子系统进化树分析

Sequencing and Analysis of Genomic B Segment of a Very Virulent Infectious Bursal Disease Virus(vvIBDV)

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【作者】 孙建和陆苹蒋静赵渝

【Author】 SUN Jian-he,LU Ping,JIANG Jing,ZHAO Yu(The Institute of Biotechnology,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 201101,China)

【机构】 上海交通大学农业与生物学院生物技术研究所上海交通大学农业与生物学院生物技术研究所 上海 201101上海 201101上海 201101

【摘要】 分离、纯化了鸡传染性法氏囊病病毒超强毒(vvIBDV)上海株(SH95)的病毒核酸dsRNA,应用随机引物将RNA反转录成cDNA,以此为模板一步扩增出全长基因组B片段,将其克隆入pGEM-T载体,并进行序列分析。克隆的B片段全长2827个核苷酸,其编码的氨基酸与超强毒株HK46的同源性达98 18%(863/879)。分子系统进化树分析表明,SH95超强毒株与美国变异株E的亲缘关系最近,但与基于基因组A片段的系统进化分析完全不同,表明该毒株在发生过程中基因重配比基因重组发挥了更重要的作用。通过对14株IBDV编码氨基酸序列的分析、比较,推测B片段上11个独特的氨基酸位点可能与毒力相关。

【Abstract】 The methods of reverse transcription,polymerase chain reaction(PCR)amplification,and cloning of full length B segment of a very virulent infectious bursal disease virus(vvIBDV)strain SH95 were developedThe use of random primer and a reverse transcriptase lacking RNase-H activity produced full length coding region and non-coding region cDNA copies of the viral genomic segmentsThe 2845 base-pairs(bp)of B segment were amplified by long and accurate PCR in a single step,successfully cloned and sequenced revealing their identity of IBDV

【基金】 上海市科学技术发展基金资助项目(01JC14034)
  • 【文献出处】 病毒学报 ,Chinese Journal of Virology , 编辑部邮箱 ,2003年02期
  • 【分类号】S852.65
  • 【被引频次】8
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