半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）基因组SNP标记的开发与检测 在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】
Isolation and Characterization of SNPs from Half-smooth Tongue Sole (Cynoglossus Semilaevis)
【作者】
庄伟 ;
【导师】
张全启 ;
【学位授予单位】
中国海洋大学 ;
【学科专业名称】
遗传学
【学位年度】
2010
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
中国海洋大学
【网络出版投稿时间】
2011-02-12
【关键词】
半滑舌鳎 ;
单核苷酸多态性 ;
PCR-SSCP ;
等位基因特异性PCR ;
【英文关键词】
Cynoglossus semilaevis ;
single nucleotide polymorphism (SNP) ;
PCR-SSCP ;
allele-specific polymerase chain reaction (AS-PCR) ;
【中文摘要】
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)是我国重要的海水养殖鱼类,其主要经济性状多数属于数量性状(QTL),受到众多基因控制,拥有复杂的遗传机制,建立高密度的遗传图谱是精确定位这些QTL以进行选择育种的必要条件。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)标记的出现,很好地解决了这一问题,SNP在基因组中的分布非常广泛,密度高,并且易于自动化分析,非常适合于建立遗传图谱,进行精确的QTL定位。但在半滑舌鳎中,SNP应用研究起步较晚,缺乏足够的SNP位点来构建遗传图谱或进行关联分析。本研究以半滑舌鳎为研究材料,探讨了半滑舌鳎SNP标记的开发及检测。
以本实验室构建的半滑舌鳎雌鱼fosmid基因组文库部分克隆的双末端测序结果为基础,对52段半滑舌鳎基因组DNA序列进行PCR-SSCP分析,检测结果发现24段序列具有SSCP多态性,通过对多态性产物测序得到115个SNP位点,SNP频率为0.74%,其中包括转换型SNP 79个、颠换型SNP 36个,并未发现三态和四态SNP位点。
根据SNP位点设计引物,通过半巢式的等位基因特异性聚合酶链式...
【英文摘要】
Half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis) is an important economic flatfish and its economic characteristics are mostly controlled by quantitative trait loci (QTL) with complex genetic mechanism. The establishment of high-density genetic map is necessary for the precise location of these QTL to selective breeding and the use of SNP markers is a good solution to it, as SNPs provide higher densities than other markers. But there are not sufficient SNP sites for the construction of genetic mapping or as...
【更新日期】
2011-05-18
【相同导师文献】
导师：张全启 导师单位：中国海洋大学 学位授予单位：中国海洋大学褶皱臂尾轮虫（Brachionus plicatilis）β-actin基因克隆分析 [D]. 中国海洋大学,2015牙鲆（Paralichthys olivaceus）TRAF6基因和TAK1基因的克隆及免疫应答研究 [D]. 中国海洋大学,2015褐牙鲆（Paralichthys olivaceus）Trx1，TRP14 和Prx1基因的克隆、表达和转录水平的免疫刺激反应 [D]. 中国海洋大学,2015牙鲆（Paralichthys olivaceus）Fspondin基因的克隆及其功能的初步探究 [D]. 中国海洋大学,2014牙鲆（Paralichthys olivaceus）冷诱导RNA结合蛋白（CIRP）基因克隆、表达分析及3D结构预测 [D]. 中国海洋大学,2014牙鲆（Paralichthys olivaceus）激活素基因两种β亚基的克隆与表达分析 [D]. 中国海洋大学,2014鲆鲽鱼Nodal信号途径相关基因的克隆与胚胎发育早期表达分析 [D]. 中国海洋大学,2013牙鲆和圆斑星鲽杂交三倍体诱导的初步研究 [D]. 中国海洋大学,2013牙鲆vasa基因的克隆、表达分析及其启动子调控的GFP报告载体构建 [D]. 中国海洋大学,2013G_3代中华卤虫遗传评定及微卫星标记的开发 [D]. 中国海洋大学,2013
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