小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位-中国优秀硕士学位论文全文数据库

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小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位

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【英文题名】	Development of EST-SSR Markers and QTL Mapping for Absorption of Elements in Wheat
【作者】	潘海涛;
【导师】	李斯深;
【学位授予单位】	山东农业大学;
【学科专业名称】	作物遗传育种
【学位年度】	2009
【论文级别】	硕士
【网络出版投稿人】	山东农业大学
【网络出版投稿时间】	2011-01-19
【关键词】	小麦; EST-SSR; 分子标记; RIL; 遗传图谱;
【英文关键词】	wheat; EST-SSR; RIL; molecular marker; genetic map;
【中文摘要】	微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats, SSR)存在于表达序列标签(expressed sequence tags, ESTs)中。为利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记,对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18～2007.2.4)进行SSR查找、特征分析,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。对RIL群体的苗期养分吸收性状进行了测定和QTL分析。主要结果如下: (1)在265362条普通小麦EST序列中,共发现6314个SSR,占整个EST数据库的2.38%。其中,二核苷酸、三核苷酸重复基元所占比例显著大于四核苷酸、五核苷酸类型。在出现频率较高的重复基元类型中,二核苷酸、三核苷酸重复基元类型最多。其中GA/CT在EST中广泛存在,是出现频率最高的重复基元类型。二核苷酸基元AG/TC、CA/GT、AC/TG也以较高地频率出现,AT/TA和TA/AT出现频率较低,GC/CG和CG/GC没有出现。三核苷酸重复基元CAA/GTT...
【英文摘要】	Microsatellite DNA markers are consistently found to be more informative than other classes of markers in hexaploid wheat. The objective of this study was to develop new simple sequence repeat (SSR) markers from EST (Expressed sequence tag) sequences for wheat. The wheat EST sequences from GenBank/dbEST (from April 18, 2006 to February 4, 2007) were used to search for SSRs, and EST-SSR primer pairs were designed by using Primer5.0 software. The validity of primer pairs were detected using three wheat variet...
【更新日期】	2011-04-15

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