【英文题名】
Cloning and Expression Analysis of FAE1 Gene from Pistacia Chinensis
【作者】
陈金波 ;
【导师】
林善枝 ;
【学位授予单位】
北京林业大学 ;
【学科专业名称】
生物化学与分子生物学
【学位年度】
2009
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
北京林业大学；陈金波
【网络出版投稿时间】
2009-09-11
【基金】
“十一五”国家科技支撑计划;
【关键词】
黄连木 ;
FAE1基因 ;
克隆 ;
生物信息学 ;
原核表达 ;
【英文关键词】
Pistacia chinensis ;
FAE1 gene ;
cloning ;
bioinformatics ;
prokaryotic expression ;
【中文摘要】
黄连木是一种重要的木本能源植物,其种子油可用于生物柴油的制取。有研究报道脂肪酸延长酶1(fatty acid elongasel,FAE1)是一种能催化脂肪酸碳链延长的酮脂酰CoA合成酶,而FAE1基因是控制黄连木油脂合成的关键酶基因。
本研究以黄连木种子为试材,根据NCBI数据库已发表的植物FAE1基因序列设计引物,运用RT-PCR和RACE技术克隆获得黄连木FAE1基因的全长cDNA序列(命名为PcFAE1),并对所获得序列进行了碱基组成、限制性酶切位点和重复片段分析。结果表明,PcFAE1基因cDNA全长1972bp,包含一个1536bp的完整开放阅读框,该序列与其它物种已克隆的FAE1基因序列高度同源,推测PcFAE1基因可能为FAE1基因。在此基础上,结合公共数据库和相关生物信息学软件,对PcFAE1基因编码蛋白的分子量、等电点等理化特性及一级、二级、三级结构进行分析和模拟。结果表明,PeFAE1蛋白是一个含511个氨基酸,相对分子量57.81kD、等电点9.28,不含信号肽,定位于细胞质的跨膜蛋白。其二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲,三级结构含有KCS蛋白家族典型的功能结...
【英文摘要】
Pistacia chinensis is an important kind of woody energy plant,and its seed oil can be used for making biodiesel.It has been reported that fatty acid elongase 1(FAE1) is aβ-ketoacyl-CoA synthase that can prolong the carbon chain of fatty acid,and FAE1 gene is a key factor in controlling lipid biosynthesis in Pistacia chinensis.
Based on the plants FAE1 sequences recorded in the NCBI,the primers were designed,and an full-length FAE1 cDNA(named as PcFAE1) with 1972bp that contained a 1536 bp ORF ...
【更新日期】
2009-10-13
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