扬子鳄微卫星位点的筛选及其多态性分析-中国优秀硕士学位论文全文数据库

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扬子鳄微卫星位点的筛选及其多态性分析

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【英文题名】	Isolation and Polymorphic Analysis of Microsatellite Loci for the Chinese Alligator
【作者】	荆伟;
【导师】	方盛国; 万秋红;
【学位授予单位】	浙江大学;
【学科专业名称】	动物学
【学位年度】	2008
【论文级别】	硕士
【网络出版投稿人】	浙江大学
【网络出版投稿时间】	2008-09-25
【关键词】	扬子鳄; 微卫星筛选; 父权鉴定概率; 遗传多样性;
【英文关键词】	Alligator sinensis; isolation of microsatellite; paternity detection probability; genetic diversity;
【中文摘要】	扬子鳄(Alligator sinensis)是我国特有的珍稀濒危保护动物。虽然扬子鳄饲养种群近年来有了较大发展,但由于奠基者效应,已发现子代繁殖衰退的迹象。随着重引入工程的启动,正确评价扬子鳄种群的遗传多样性现状,从而制定更加有效的保护策略,已成为当务之急。本研究利用磁珠富集法,筛选扬子鳄自身的多态性微卫星位点,同时利用这些位点对两个扬子鳄种群的遗传多样性和种群结构进行了比较分析,主要研究结果如下: 1.共挑取4000个克隆,检测后得到260个阳性克隆。随机抽取其中的150个克隆进行测序,其中92个序列可供设计微卫星引物,56对引物能成功扩增出预期大小的产物。对这56对引物进行多态性检测后,最终获得扬子鳄的11个多态性微卫星位点。 2.57只扬子鳄经以上11个多态性微卫星位点检测后,共获得31个等位基因,平均每个位点的等位基因数为2.82个。其中,有4个等位基因(Alsi05-1;Alsi06-1;Alsi07-1;Alsil0-1)为长兴本土种群所特有,1个等位基因(Alsi05-2)为美国重引入种群所特有。11个位点的平均多态信息含量(PIC)为0.384。 ...
【英文摘要】	Chinese alligator (Alligator sinensis) is a critically endangered species endemic to China. Although the captive Chinese alligator populations have been greatly developed in recent years, there has been genetic depression in the filial generation because of the founder effect. As the startup of the reintroduction project for the captive Chinese alligator population, it is urgent to investigate the genetic status of this species and provide feasible strategies for its conservation. In this study,...
【更新日期】	2008-12-08

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