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扬子鳄基因组BAC文库及MHC Ⅰ类基因BAC克隆重叠群的构建  
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【英文题名】 Construction and Characterization of Genomic BAC Library and BAC Contig of MHC Class Ⅰ of Chinese Alligator
【作者】 王晓亮;
【导师】 方盛国; 万秋红;
【学位授予单位】 浙江大学;
【学科专业名称】 动物学
【学位年度】 2008
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 浙江大学
【网络出版投稿时间】 2008-09-25
【关键词】 扬子鳄; 基因组BAC文库; MHC; I类基因; 克隆重叠群;
【英文关键词】 Chinese Alligator; Genomic BAC library; MHC class I gene; contig;
【中文摘要】 扬子鳄(Alligator sinensis)是我国特有的珍稀濒危野生动物,长期以来,由于人类的捕杀和栖息地的丧失,其野外种群的数量已不足120条。为了保护这一珍稀濒危物种的基因资源,本论文以长兴扬子鳄自然繁育研究中心提供的血液样品为材料,以细菌人工染色体(BAC)为载体,建立了高容量的扬子鳄基因组BAC文库。同时在基因组BAC文库的基础上,利用PCR和DNA Walking步移法等技术,构建了扬子鳄MHCⅠ类基因组的克隆重叠群,从而为后续开展MHC基因组的物理图谱构建,以及MHC的基因组计划等工作,提供了关键的材料平台。主要研究结果如下: 1.以新鲜血液为材料,利用pCC1BAC载体,成功构建了扬子鳄的基因组细菌人工染色体(BAC)文库。文库包含的164,352个BAC克隆,保存于1,712块96孔培养板上。经对随机挑取的150个BAC克隆进行脉冲电泳检测,计算出文库的平均插入片段为90kb,覆盖扬子鳄基因组约5.2倍(除去5.33%的空载体)。同时,从文库中获得任一单拷贝或多拷贝扬子鳄基因的概率为99.63%。 2.用9对PCR引物筛BAC文库分别可以得到2-9个阳性克隆,...
【英文摘要】 The Chinese Alligator(Alligator sinensis)is rare and endangered species endemic to China.Due to environmental deterioration and habitat loss,the population of the Chinese Alligator declined rapidly.In order to protect the rare and endangered species,lots of the researches about Chinese Alligator conservation have begun. In this study,we constructed a high-quality bacterial artificial chromosome (BAC)library of the Chinese Alligator with fresh blood,which was provided by Changxing Research base o...
【更新日期】 2008-12-08

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