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欧文氏杆菌铁代谢相关基因生物信息学分析  
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【英文题名】 Bioinformatics Analysis of Iron Uptake-related Gene in Erwinia
【作者】 刘廷辉;
【导师】 董金皋;
【学位授予单位】 河北农业大学;
【学科专业名称】 植物病理学
【学位年度】 2006
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 河北农业大学
【网络出版投稿时间】 2006-07-13
【关键词】 欧文氏软腐菌; 铁代谢相关基因; 铁载体; 铁调控蛋白; 生物信息学分析;
【英文关键词】 Erwinia; iron uptake-related gene; siderophore; Fur; bioinformatics;
【中文摘要】 铁是所有细菌活细胞代谢必要的微量营养元素。研究发现,铁不仅影响病原菌的生长,还与病原菌的致病性密切相关,它调控着许多致病基因的表达。本文通过实验证明了铁与植物病原细菌Erwinia carotovora var.carotovora(简称Ecc)和Erwinia carotovora subsp.atroseptica(Eca)的生长与致病性的关系,利用生物信息学方法查找和分析了Eca中与铁代谢相关的基因。 为了研究铁与植物病原细菌Ecc和Eca的生长与致病性的关系,本实验采用生物学测定和分子检测相结合的试验方法,用不同浓度的Fe~(3+)分别处理各供试菌株,测定了Ecc和Eca的生长与致病性。结果表明,在一定浓度下,Fe~(3+)对Ecc和Eca的各菌株生长及致病性均有促进作用,其中,0.1-1mmol/L的Fe~(3+)对其生长和致病性促进作用明显。 利用NCBI/Blast 2.2.13,DNAMAN,DNAStar和TreeView等软件对Eca基因组中与铁代谢相关的基因进行生物信息学分析,共查询到了70个与铁代谢相关的基因。其中,有50个基因为...
【英文摘要】 Iron is the necessary micronutrient for cellular metabolism used by almost all bacteria. It has been found that iron has effect not only on the growth , but also on the pathogenicity of the pathogens. It regulates expression of pathogenic genes. In this paper, the result showed that iron is relative to the growth and pathogencity of the pathogen Erwinia carotovora var. carotovora and Erwinia carotovora subsp. atroseptica. And then the related genes to iron metabolism are found and analyzed by bioinformatics...
【更新日期】 2006-09-13

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导师:董金皋    导师单位:河北农业大学    学位授予单位:河北农业大学
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