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应用3’RACE技术扩增仿刺参C型凝集素基因及实验条件的优化  
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【英文篇名】 Clone of C-type lectin gene of sea cucumber Apostichopus japonicus and optimization of experimental conditions using 3' RACE technique
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【作者】 李莹; 韩璐璐;
【英文作者】 LI Ying1; HAN Lu-lu2(1.Liaoyang Vocational Technology College; Liaoyang 111004; China; 2.School of Life Sciences; Liaoning Normal University; Dalian 116081; China);
【作者单位】 辽阳职业技术学院; 辽宁师范大学生命科学学院;
【文献出处】 辽宁师范大学学报(自然科学版) , Journal of Liaoning Normal University(Natural Science Edition), 编辑部邮箱 2012年 02期  
期刊荣誉:ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 仿刺参; C型凝集素; 3’RACE技术;
【英文关键词】 Apostichopus japonicus; C-type lectin; 3'RACE technique;
【摘要】 从GenBank上调取刺参C型凝集素(C-type Lectin)基因序列EST,根据此序列设计RACE引物,采用PCR扩增技术得到了仿刺参C-type Lectin基因序列(EST),根据这段EST序列设计1个基因特异引物(GSPF),与通用引物(UPM)扩增,成功地克隆到了该基因的3’末端序列.同时,对仿刺参C型凝集素基因3’克隆的实验条件进行了优化.该扩增片段长度为670bp,与已知序列重叠部分为417bp.经测序和比对发现该段序列与预期的目标基因的序列一致.
【英文摘要】 The express sequence tag(EST) of C-type lectin of Apostichopus japonicus from GenBank was obtained.Based on this sequence,we utilize software of primer 5.0 to design a pair of RACE primer.After the PCR reaction,the cDNA sequence of C-type lectin of Apostichopus japonicus was obtained.Based on part of the known partial cDNA sequence,gene specific primers(GSPF) was designed which work together with universal primers(UPM).The 3' cDNA end of C-type lectin in Apostichopus japonicus was successfully cloned.At the...
【基金】 辽宁省海洋与渔业科研项目(2011007); 辽宁省教育厅创新团队项目(2009T054); 大连市科技攻关计划项目(2007B11NC066)
【更新日期】 2012-07-09
【分类号】 S917.4
【正文快照】 RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是基于PCR技术基础上,由已知的一段cDNA片段,通过往两端延伸扩增从而获得完整的3’端和5’端的方法[1-2].经典的RACE技术是由Frohman et al.于1988年发明的[3].经过长期的改进,此种方法可以从低丰度的转录本中快速有效的对基因末端进行?

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