新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析-中国学术期刊网络出版总库

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新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析

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【英文篇名】	Detection and Analysis of Partial Sequences of Swine Hepatitis E Virus in Xinjiang
【下载频次】	★★★★☆
【作者】	马勋; 陆承平;
【英文作者】	MA Xun; LU Cheng-ping**(Key Laboratory of Animal Disease Diagnostic & Immunology; Ministry of Agriculture; Nanjing Agricultural University; Nanjing 210095; China);
【作者单位】	南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室; 南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室江苏南京; 江苏南京;
【文献出处】	中国病毒学 , Virologica Sinica, 编辑部邮箱 2004年 04期期刊荣誉：ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】	戊型肝炎病毒; 基因型; RT-nPCR;
【英文关键词】	Hepatitis E virus; Genotype; Reverse transcription nested polymerase chain reaction;
【摘要】	从戊型肝炎病毒(HepatitisEvirus,HEV)IgG检测阳性的新疆某猪场采集70份猪粪便,利用逆转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测HEVRNA,其中13份为阳性,阳性率18.57%。将PCR扩增产物克隆到pMD18-T载体上,构建成重组质粒并测序,结果表明,13株猪源HEV分离株在HEVORF2348bp核苷酸序列的同源性为97.1%～100%,为同一基因型;与HEVⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ的同源性分别为74.1%～77.6%,71.6%～74.1%,73.3%～78.2%和82.8%～91.4%,与ⅣA亚型的同源性同源性最高达89.4%～91.4%。以该核苷酸片段绘制的基因进化树显示13株猪源HEV与HEVⅣT1株在同一分支上,属基因Ⅳ型;与国内其他猪源HEV分离株该片段核苷酸序列的同源性为82.6%～91.3%,提示中国猪源HEV的基因型比较一致,同属HEVⅣ型。
【英文摘要】	To investigate Hepatitis E virus,(HEV) infection in swine in Xinjiang and the extent of genetic variation among Chinese swine HEV strains, seventy pig fecal samples from an anti-HEV positive farm in Xinjiang were tested for the presence of HEV RNA by reverse transcription nested polymerase chain reaction (RT-nPCR). Thirteen of 70 (18.57%) pigs were positive for HEV RNA. The nucleotide sequence of 348bp region within open reading frame 2(ORF2) of the 13 swine HEV isolates was determined. The DNAstar software...
【更新日期】	2005-08-19
【分类号】	S854.4
【正文快照】	戊型肝炎病毒(HepatitisEvirus,HEV)是一种严重危害人类健康的肝炎病毒,世界范围内存在,其核酸类型为单股正链RNA,大小约7.2kb,包括5’非翻译区(UTR),三个开放读码框架(ORFs1-3)和有PolyA尾的3’非翻译区。ORF1位于第28-5107nt之缓冲液4μL,10mmol/LdNTPs2μL,P2(40pmoL/μL)间

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