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规模化猪场粪污细菌总DNA DGGE指纹图谱及耐药性分析     在线阅读　整本下载　分章下载　分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Study on DGGE Fingerprin and Antibiotics Resistance of the Bacteria Metagenome in Manure from Large-scale Pig Farms
【作者】 魏勇;
【导师】 王红宁;
【学位授予单位】 四川农业大学;
【学科专业名称】 预防兽医学
【学位年度】 2011
【论文级别】 博士
【网络出版投稿人】 四川农业大学
【网络出版投稿时间】 2011-11-25
【关键词】 猪场粪污; PCR-DGGE; 16S; rDNA文库; 细菌总DNA; 耐药基因;
【英文关键词】 Pig manure; PCR-DGGE; 16S rDNA library; bacteria metagenome; Antibiotic resistance gene;
【中文摘要】 养殖粪污中细菌等微生物的种类、数量、存活时间及其耐药性等直接关系到生态环境保护、人与动物的健康。养殖粪污作为丰富的耐药基因库,在细菌及其耐药性的传递、保有、转归等多个环节具有重要作用,而养殖粪污耐药基因的传递与转归也并不总是依赖活细菌或可培养细菌；猪场粪污中含有丰富的可培养及不可培养细菌类群,其细菌类群随环境综合因素复杂变化而变化,因而其细菌及其耐药性研究较困难；已有研究以细菌培养及其药敏筛选方法为主,难以准确获取猪场粪污中的细菌及其耐药基因信息,因此开展规模化猪场粪污总DNA指纹图谱及其耐药性研究有重要意义。本试验研究针对规模化养猪生产中以沼气为纽带的循环利用系统的粪污处理主流模式,以规模化猪场粪污总DNA为主要研究对象,采用PCR-DGGE、multi-PCR等现代分子生物学及生物信息学分析方法开展研究,取得了以下结果： 1 PCR-DGGE用于猪场粪污细菌群落分析的方法优化 针对猪场粪污总DNA样品,以变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)方法为研究对象,对基于16S rDNA V3区的PCR-DGGE电泳的最佳变性剂梯度范围、电泳时间、染色时间进行了优化。研究结果表明：最佳变性剂梯度范围...
【英文摘要】 Presently, the biological and physical variable of microflora in pig manure is not clear yet. In this study, denaturing gradient gel electrophoresis was optimized in the running parameters including level electrophoresis, electrophoresis time and dying time, respectively. The optimized DGGE method was subsequently performed to analyze the diversity of the manure samples from 5 main running scenorios of 5 pig farms distributed along Jialing River. And then, bacterial 16S rDNA clone library of corresponding m...
【更新日期】 2012-04-18

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导师：王红宁    导师单位：四川农业大学    学位授予单位：四川农业大学
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