【英文题名】
Study on ESTs and Cloning, Expression of Genes Related to Immunity of Haliotis Discus Hannai
【作者】
郑明刚 ;
【导师】
孙修勤 ;
【学位授予单位】
中国海洋大学 ;
【学科专业名称】
海洋生物学
【学位年度】
2007
【论文级别】
博士
【网络出版投稿人】
中国海洋大学
【网络出版投稿时间】
2008-01-04
【关键词】
皱纹盘鲍 ;
cDNA文库 ;
表达序列标签 ;
神经肽Y受体 ;
半乳糖凝集素 ;
同种异体移植炎症因子-1 ;
微卫星 ;
【英文关键词】
Haliotis discus hannai ;
cDNA library ;
ESTs ;
NPY receptor ;
Galectin ;
AIF-1 ;
SSR ;
【中文摘要】
本论文以皱纹盘鲍为研究对象,构建了其肝、肾组织的cDNA文库,并对文库进行了一定规模的测序。利用EST提示的信息成功克隆了与免疫相关的三个基因,神经肽Y受体、半乳糖凝集素和同种异体移植炎症因子-1。此外,还从EST序列中开发了15个微卫星标记,并利用这些标记对皱纹盘鲍两个养殖群体的多样性进行了分析。现将结果摘要如下:
(1)以皱纹盘鲍的肝、肾组织为材料,构建了cDNA文库。经测定,库容为5.24×10~5 cfu/mL、插入片段大小为0.8~2.5 Kb。挑取文库中1445个重组克隆进行序列测定,得到了1282条高质量的EST。聚类分析得到了876个基因聚类,同源性对比发现有393个获得了功能提示,占总数的45%,其中与免疫相关的基因聚类有63个。
(2)根据EST提供的信息,采用RACE技术成功克隆了神经肽Y受体基因的全长cDNA序列。该序列全长1534 bp,包含一个59 bp的5′-UTR和396 bp的3′-UTR,开放阅读框长1053 bp,编码350个氨基酸。生物信息学分析发现,此NPY受体具有7个α跨膜螺旋,N端在胞外,被糖基化,C端在胞内,被磷...
【英文摘要】
A cDNA library from Haliotis discus Hannai was constructed and expressed sequence tags were sequenced. Three genes related to immunity were cloned using RACE such as NPY receptor, Galectin and AIF-1. 15 microsatellite loci were obtained, and genetic diversity was analysed in 2 cultured populations of Haliotis discus Hannai. The main results are introduced as follows:
(1) The cDNA library of the liver and kidney from the Vibrio anguillarum-infected Haliotis discus Hannai was constructed. Th...
【更新日期】
2008-03-20
【相同导师文献】
导师：孙修勤 导师单位：中国海洋大学 学位授予单位：中国海洋大学养殖仿刺参对环境因子和病原的免疫应答及抗病分子机理 [D]. 中国海洋大学,2013淋巴囊肿病毒中国分离株（LCDV-cn）系统关系分析与功能基因研究 [D]. 中国海洋大学,2008淋巴囊肿病毒口服微囊核酸疫苗的研制与免疫效果研究 [D]. 中国海洋大学,2008牙鲆淋巴囊肿病自愈机制的研究 [D]. 中国海洋大学,2008皱纹盘鲍和栉孔扇贝抗菌肽的研究 [D]. 中国海洋大学,2008共轭亚油酸两种主要异构体的分离及生理功能研究 [D]. 中国海洋大学,2008刺参器官再生的组织学与相关基因研究 [D]. 中国海洋大学,2006海水养殖鱼蛋白质感染因子（PrPC）的研究 [D]. 中国海洋大学,2006牙鲆促性腺激素释放激素及其免疫影响的研究 [D]. 中国海洋大学,2006淋巴囊肿病毒（Lymphocystis disease virus）核酸疫苗的免疫效果评价及安全性研究 [D]. 中国海洋大学,2006
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