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结球大白菜表达序列标签数据库构建与软腐病菌胁迫下的基因表达分析     在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Construction of Chinese Cabbage Expressed Sequence Tags Database and Analysis of the Genes Expression under Erwinia Carotovora Stress
【作者】 张松贺;
【导师】 杨清; 马荣才;
【学位授予单位】 南京农业大学;
【学科专业名称】 生物化学与分子生物学
【学位年度】 2006
【论文级别】 博士
【网络出版投稿人】 南京农业大学
【网络出版投稿时间】 2007-11-05
【基金】 国家高技术研究发展计划(863计划);北京市自然科学基金;
【关键词】 结球大白菜; 软腐病; 基因表达序列标签; 基因芯片; 木质素; 基因表达;
【英文关键词】 Chinese cabbage; Erwinia carotovora subsp. carotovora; Expressed Sequence Tag EST; cDNA library; Lignin; Gene expression;
【中文摘要】 结球大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis),原产于我国,是我国北方重要蔬菜之一,广泛种植在东亚地区。结球大白菜软腐病是由软腐病菌(Erwinia carotovorasubsp.carotovora)引起的,是结球大白菜三大病害之一,造成结球大白菜大量减产和品质下降。目前生产上高抗软腐病品种资源少,加之对结球大白菜抗病机制认识的匮乏,从而严重影响了抗软腐病育种工作进程。为从分子水平研究和理解结球大白菜抗软腐病的分子机制,本文通过对受软腐病菌感染的结球大白菜SSH cDNA文库进行大规模测序、构建ESTs(基因表达序列标签)数据库、开发数据库管理软件和制作cDNA芯片,对结球大白菜抗软腐病基因表达谱进行了分析。在此基础上,研究了木质素的合成在结球大白菜防卫软腐病反应中的变化。研究的主要结果如下: 1、结球大白菜ESTs数据的获取与分析 本研究对已构建的SSH cDNA文库进行测序,获取了5,242条高质量ESTs,连同实验室以前所测的部分序列,最终共获得了6,282条ESTs。经利用DNAStar6.0的SeqmanⅡsoftware进行序列拼接分析,将...
【英文摘要】 Chinese cabbage (Brassica rapa subsp. pekinensis) originated from China, is one of Chinese people's favorite vegetable and widely planted in east Asia. Soft-rot disease caused by soft-rot pathogens Erwinia carotovora subsp.carotovora (Ecc), is one of the three important diseases of Chinese cabbage, and often causes product quality reduction and bad quality. Due to lacking available disease resistance materials and limitations in understanding the resistant mechanisms, Ecc-resistance breeding has been ...
【更新日期】 2008-08-29

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