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拟南芥抗旱候选基因的SNP及其与抗旱性状的相关性分析以及ATHK1基因的功能研究     在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Nucleotide Polymorphisms at the Drought Candidate Gene Loci of Arabidopsis Thaliana and Their Association Study with Drought Index and Functional Study of ATHK1
【作者】 郝岗平;
【导师】 杨清; 黄丛林;
【学位授予单位】 南京农业大学;
【学科专业名称】 生物化学与分子生物学
【学位年度】 2004
【论文级别】 博士
【网络出版投稿人】 南京农业大学
【网络出版投稿时间】 2004-07-13
【关键词】 拟南芥; CBF4; ATHK1; NCED3; 单核苷酸多态性(SNP); 抗旱性状; 相关分析; ATHK1突变体; 渗透感受器;
【英文关键词】 Arabidopsis thaliana; CBF4; ATHK1; NCED3; Single nucleotide polymorphism; trait of drought tolerance; ATHK1-mutant; Osmosensor;
【中文摘要】 本研究以生长于不同生态气候条件下的32个拟南芥核心生态型为材料,分析了它们的抗旱指标和综合抗旱性,同时通过直接测序法分析了抗旱转录因子CBF4,组氨酸蛋白激酶ATHK1和ABA合成关键酶基因NCED3的单核苷酸多态性(SNP)。 结果表明,不同的拟南芥生态型具有差异明显的抗旱性,抗旱综合聚类分析将32个生态型聚合为4类:强抗旱、抗旱、中等抗旱和干旱敏感型。 CBF4基因位点核苷酸多态性的频率为每35.8bp一个SNP,每143 bp一个插入/缺失(Indel)。编码区SNP的频率为每96.4bp一个SNP,其中1034位(以GenBank No.AB015478序列第19696位的核苷酸为1)碱基变化:GT,引起第205位氨基酸变化:glyval。基因非编码区的多态性是编码区的4倍,表明编码区承受着更大的选择压力。Tajima’S D统计学检验结果是各区域都不显著,说明该区域核苷酸变化符合中性突变假说,较高的核苷酸多样性是净化选择的结果。相关性分析表明CBF4基因5′端非编码区的核苷酸变化与拟南芥综合抗旱性相关,氨基酸变化与综合抗旱性不相关。 ...
【英文摘要】 The levels of drought tolerance and nucleotide polymorphism at transcription factor CBF4, ATHK1 and key enzyme regulating abscisic acid (ABA) synthesis NCED3 locus in a worldwide sample of 32 core accessions of Arabidopsis thaliana were examined. The results showed that different accessions had quite difference in adaptation to drought stress. Thirty-two core accessions of Arabidopsis thaliana were classified in four clusters by synthetical analysis of drought tolerance. The frequency of nucleotide...

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