【英文题名】
Variable Selection Based on ISIS and Its Application for Semi-parametric Additive Hazard Model with High-dimensional Data
【作者】
刘志坚 ;
【导师】
田考聪 ;
【学位授予单位】
重庆医科大学 ;
【学科专业名称】
流行病与卫生统计学
【学位年度】
2017
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
重庆医科大学
【网络出版投稿时间】
2017-09-22
【关键词】
高维数据 ;
AHAZISIS模型 ;
AHAZSSCADISIS模型 ;
AHAZLASSOISIS模型 ;
AHAZENISIS模型 ;
【英文关键词】
High-Dimensional Data ;
AHAZISIS model ;
AHAZSSCADISIS model ;
AHAZLASSOISIS model ;
AHAZENISIS model ;
【中文摘要】
目的本文主要介绍高维数据下半参数可加危险率模型中基于ISIS的变量选择方法,并探讨AHAZISIS模型,AHAZLASSOISIS模型,AHAZENISIS模型,AHAZSSCADISIS模型在高维数据生存分析中的优劣。从而揭示死亡或其他生存结局发生的时间与基因表达之间的关系,从基因层面上为疾病的诊疗和预后以及改进治疗方案提供依据。方法介绍AHAZISIS模型,AHAZLASSOISIS模型,AHAZENISIS模型和AHAZSSCADISIS模型的基本方法原理。针对生物信息学高维度,强相关,小样本量的数据特征进行数据模拟,并比较四种模型在不同模拟数据下的表现情况。最后利用来源于TCGA的前列腺癌数据进行实证研究。结果(1)各种模拟数据情形下,三种初次惩罚函数的模拟结果在一致性和精确性的表现上差别不大。(2)各种数据情形下,四种再次惩罚函数在一致性方面OS-SCAD表现最好,SSCAD次之,Lasso第三,EN表现最差;而在精确性方面,OS-SCAD和SSCAD较好,Lasso次之,EN表现最差。(3)各种数据情形下,再次惩罚函数SSCAD的不同steps在一致性方面,steps=1表现最好,steps=2,...
【英文摘要】
Objective To introduce the variable selection based on ISIS and its application for semiparametric additive hazard model with high dimensional data.And explored the advantages and disadvantages of AHAZLASSOISIS model,AHAZENISIS model,AHAZISIS model,AHAZSSCADISIS model through analyze the highdimensional survival data,to reveal the relationship between the time of death or other survival ends occurrence and the gene expression.Provide the basis for the diagnosis and treatment of disease and improve treatment...
【更新日期】
2018-01-01
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