基于RNA-seq进行小桐子在干旱胁迫响应与适应过程中的转录组分析及其关键基因的克隆和功能验证-中国优秀硕士学位论文全文数据库

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基于RNA-seq进行小桐子在干旱胁迫响应与适应过程中的转录组分析及其关键基因的克隆和功能验证

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【英文题名】	RNA-seq-Based Transcriptomic Analysis,cloning & Functional Characterization of Key Genes Involving Drought Stress Adaptation and Responses in Jatropha Curcas
【作者】	张博;
【导师】	龚明; 王莎莎;
【学位授予单位】	云南师范大学;
【学科专业名称】	生物化学与分子生物学
【学位年度】	2017
【论文级别】	硕士
【网络出版投稿人】	云南师范大学
【网络出版投稿时间】	2017-10-11
【基金】	国家自然科学;
【关键词】	小桐子; 干旱锻炼; 耐旱性; 高通量测序; 基因克隆; 酵母表达;
【英文关键词】	Jatropha curcas; Drought hardening; Drought resistance; Digital gene expression profile; Gene cloning; Yeast expression;
【中文摘要】	小桐子是具有巨大开发潜力的能源植物树种,干旱是限制小桐子产业发展的重要环境因素。因此,弄清小桐子抗旱性形成的分子机制,获取跟抗旱性密切相关的关键基因,并通过基因工程手段进行初步改良已成为急需解决的问题。本研究主要是通过借助Illumina Hiseq 2000高通量测序系统对小桐子模拟干旱锻炼和空气胁迫过程中的转录组进行RNA-seq解析,通过鉴定干旱响应的差异表达基因及其功能富集分析,阐明小桐子在干旱响应和适应过程中的转录组响应全景,进而克隆并获得了两个与抗旱性相关的差异表达关键基因,为揭示小桐子干旱锻炼下抗旱性形成的分子机制和为后续通过基因工程手段改良小桐子提供了坚实的理论和实验基础。研究结果如下:1.以生长三周的小桐子幼苗为实验材料,经10%PEG 6000模拟干旱锻炼48h(设置5个取样点:0 h、6 h、12 h、24 h、48 h),之后转入空气干旱胁迫72h(设置3个取样点:24 h、48 h、72 h),未经干旱锻炼的幼苗同样进行空气干旱胁迫72 h,并于胁迫结束后取样。每份叶片样本均取自5株独立植株,均匀混样,记为三次生物学重复,用于cDNA文库构建和RNA-seq测序。经过滤去除低质量re...
【英文摘要】	Jatropha curcas is an energy plant with great potential for exploration.Drought is an important environmental factor restricting the development and cultivation of J.curcas.Therefore,it is becoming an urgent task to elucidate the molecular mechanism underlying drought responses in J.curcas,which will provide detailed information on genetic breeding strategies aimed at improving traits with adaptation and tolerance to drought stress.Here,the drought responsive process in J.curcas leaves was investigated over...
【更新日期】	2018-01-18

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