中国优秀硕士学位论文全文数据库
  关闭
玉米应答干旱胁迫的转录表达谱数据挖掘及WRKY基因家族的分子进化  
   在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Systemic Analysis of RNA-seq Expression Patterns in Mazie under Drought and Phylogenetic Analysis of the WRKY Transcription Factor
【作者】 张庭;
【导师】 张小燕; 韩兆雪; 马闯;
【学位授予单位】 西北农林科技大学;
【学科专业名称】 植物资源学
【学位年度】 2017
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 西北农林科技大学
【网络出版投稿时间】 2017-07-17
【关键词】 玉米; 干旱胁迫; 转录组学; 共表达网络; WRKY转录因子;
【英文关键词】 maize; drought stress; RNA-seq; WRKY transcription factor;
【中文摘要】 干旱等非生物胁迫是严重影响植物生长发育以及后期产量的环境因素。为了适应不利环境,植物进化出复杂的应答机制,包括转录调控、表观修饰、代谢重整等。在转录调控网络中,转录因子处于中心地位,能够调节成百上千的下游基因的表达。本研究对正常和干旱胁迫条件下玉米B73三种不同组织和四个发育时期的24组转录组数据进行分析及构建共表达网络;进一步研究了玉米WRKY转录因子家族的系统进化关系与干旱应答表达谱,具体研究结果如下:1.通过转录组数据的比对、拼接和表达量计算,发现至少在一组样品中表达的基因有27885个,而52.24%(14625/27885)的基因在24组样品中都有表达。进一步差异表达分析发现了11284个差异表达基因,其中干旱胁迫下雌穗和叶片的R1时期差异表达基因数目最多,而雄穗不同时期的差异基因数目都相对较少。2.使用WGCNA包将差异表达基因划分为10个模块。不同模块与基因的组织时期特异性表达有关,暗示着不同的功能。进一步GO富集分析发现这些功能包括叶绿体光合作用、酶活性、花粉管生长、膜转运、细胞壁、胁迫响应、转录调控、水解酶活性等。共表达网络包含844个枢纽基因,15.4%的枢纽基因存在全基因组复制事件,基因...
【英文摘要】 Drought and other abiotic stress is the serious environmental stresses affecting plant growth,development,crop yield,and productivity.To cope with environment stress,plants have evolved complex adaptive mechanisms,including regulation of transcription,epigenetic plasticity,metabolic reprogramming,and so on.Transcription factors play a central role in the transcription networks though regulating the expression of hundreds of downstream genes.Here,drought-sensitive maize B73 was used as the material,and the d...
【更新日期】 2018-01-01

xxx
【读者推荐文章】中国期刊全文数据库 中国重要报纸全文数据库 中国博士学位论文全文数据库 中国优秀硕士学位论文全文数据库 中国重要会议论文全文数据库
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
点击下列相关研究机构和相关文献作者,可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献,使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献,从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。

农业科学
  农作物
   禾谷类作物
    玉米(玉蜀黍)

生物科学
  植物学
   植物细胞遗传学
    植物基因工程
  
 
  CNKI系列数据库编辑出版及版权所有:中国学术期刊(光盘版)电子杂志社
中国知网技术服务及网站系统软件版权所有:清华同方知网(北京)技术有限公司
其它数据库版权所有:各数据库编辑出版单位(见各库版权信息)
京ICP证040431号    互联网出版许可证 新出网证(京)字008号