【英文题名】
Research on the Software System for Q-PCR Applications Based on Improved Quantitative Mathematical Model
【作者】
彭旭峰 ;
【导师】
陈章位 ;
【学位授予单位】
浙江大学 ;
【学科专业名称】
机械电子工程
【学位年度】
2015
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
浙江大学
【网络出版投稿时间】
2015-10-15
【关键词】
PCR ;
定量数学模型 ;
定量PCR仪软件 ;
【英文关键词】
PCR ;
quantitative mathematical model ;
Q-PCR instrument software ;
【中文摘要】
聚合酶链式反应(PCR)技术作为生物医学领域研究的重要手段之一,历经30年快速发展至今,已经被广泛应用于生命科学、药物研发、疾病诊断等领域。我国对PCR技术的研究起步较晚,目前荧光定量PCR仪的市场基本被国外企业垄断。本文从定量数学模型入手,通过研究国内外已有的数学模型,分析比较后发现基于Logistic函数的数学模型更符合PCR扩增的动态规律,对荧光数据具有较高的定量精度。在对该算法作了适当改进和优化后,本文通过Matlab仿真验证了该改进型定量数学模型的有效性和适用性,并在此基础上本文设计开发了PC端的定量PCR仪软件,即荧光定量PCR仪的上位机软件,来实现对PCR扩增荧光数据的定量分析。根据定量PCR仪软件的需求分析报告确定软件的功能框架,并将框架中各个功能进行模块划分后把定量PCR仪软件分为实验设计和数据分析两部分。根据用户确定实验方案的逻辑顺序和相应荧光定量PCR实验所需的设置参数,设计了直观友好的实验方案界面,编板设置界面等多个软件界面,分别实现软件的各个功能模块。此外,定量PCR仪软件还要能够实现用户与荧光定量PCR仪的人机交互。荧光定量PCR仪的CPU采用ARM处理器,可由RS232串口与PC...
【英文摘要】
Polymerase chain Rection(PCR) technology, as one of the best tools to research biomedical science, has already been widely used in bioscience, drug discovery, disease diagnosis, and other fields after 30 years of development. The market of real-time Quantitative PCR instruments is basically monopolized by foreign companies so far while the research of PCR technology in our country is started late. In this circumstance, this paper starts from the quantitative mathematical model of PCR and studies current res...
【更新日期】
2016-03-08
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